Histoire de la Grèce antique (relations sociales des périodes hellénistiques et romaines) Histoire des relations entre hellénisme et judaïsme Histoire du christianisme antique
Ses travaux portent sur le christianisme ancien, les romans grecs et l’histoire du judaïsme de langue grecque, plus spécialement sur les questions sociales des périodes hellénistique et romaine, accordant une grande importance à la documentation épigraphique[2]. Elle s'applique notamment à l'analyse des relations entre hellénisme et judaïsme, depuis la traduction de la Septante jusqu'à l'émergence du christianisme[4]. Elle étudie les interactions entre les religions du monde gréco-romain, s'intéressant particulièrement au phénomène de la violence religieuse[2] et des persécutions ainsi qu'aux structures de communautés religieuses[5].
Membre de l’Association catholique française pour l'étude de la Bible (ACFEB), elle a publié de nombreux ouvrages et articles, a participé à divers ouvrages collectifs et a édité Les premiers temps de l'Église pour les éditions Gallimard/Le Monde de la Bible. Elle a aussi animé un séminaire à l'École normale supérieure de la rue d'Ulm consacré aux « Religions et sociétés dans le monde gréco-romain »[6].
Marie-Françoise Baslez meurt à Paris le , à l'âge de 75 ans[2],[7].
Les Premiers bâtisseurs de l'Église : Correspondances épiscopales (IIe – IIIe siècles), Paris, Fayard, coll. « Histoire », , 304 p. (ISBN978-2-213-67287-8, présentation en ligne)
Jésus : Dictionnaire historique des évangiles, Paris, Omnibus, , 968 p. (ISBN978-2258136311)
Jésus : Dictionnaire historique des évangiles, Editions Tallandier, coll. « Poche », , 300 p. (ISBN979-1-0210-4040-3)
Marie-Françoise Baslez, Philippe Hoffmann, et Monique Trédé, Études de littérature ancienne. Tome 4, Le monde du roman grec et Études de littérature ancienne. Tome 5, L'invention de l'autobiographie, Paris, éd. Presses de l'École normale supérieure, 1992
Marie-Françoise Baslez (dir.), L'Orient méditerranéen de la mort d'Alexandre au Ier siècle avant notre ère : Anatolie, Chypre, Égypte, Syrie, collectif, Paris, éd. du Temps, 2003
Marie-Françoise Baslez (Textes présentés par), Les premiers temps de l'Église, Gallimard, coll. « Folio histoire », (ISBN978-2-07-030204-8)
Marie-Françoise Baslez, Françoise Prévot (dir.), Prosopographie et histoire religieuse (Actes du colloque tenu en l'Université Paris XII-Val-de-Marne les 27 & 28 octobre 2000), Paris, éd. De Boccard, 2005
Marie-Françoise Baslez, Didier Nourrisson, Michel-Yves Perrin, Abdelkader Belbahri (dir.), Le barbare, l'étranger : images de l'autre (Actes du colloque organisé par le CERHI : Saint-Étienne, 14 et 15 mai 2004), Saint-Étienne, éd. Publications de l'Université de Saint-Étienne, 2005
Marie-Françoise Baslez (dir.), Dieu(x) et hommes : histoire et iconographie des sociétés païennes et chrétiennes de l'Antiquité à nos jours : mélanges en l'honneur de Françoise Thelamon, Rouen, éd. Presses universitaires de Rouen et du Havre, 2005
Marie-Françoise Baslez (dir.), Marie-Christine Marcellesi, Isabelle Pernin, Alexandre Avram et Eric Perrin-Saminadayar, Économies et sociétés en Grèce ancienne 478-88, Paris, Atlande, , 507 p. (ISBN978-2350300511)
Marie-Françoise Baslez, André Encrevé, Rémi Fabre et Corinne Péneau (dir.), Guerre juste, juste guerre : les justifications religieuses et profanes de la guerre de l'Antiquité au XXIe siècle, Paris, éd. Université Paris-Est Créteil, 2013
Marie-Françoise Baslez (dir.) et Olivier Munnich (dir.), La mémoire des persécutions : Autour des livres des Maccabées, Paris-Louvain, Peeters, coll. « Revue des Études juives » (no 56), , 406 p. (ISBN978-2-7584-0222-0)
Marie-Françoise Baslez et Christian-Georges Schwentzel (dir.), Les dieux et le pouvoir : aux origines de la théocratie, Rennes, éd. Presses universitaires de Rennes, 2016
Régis Burnet et Marie-Françoise Baslez, « Des concurrents au christianisme ? : Les cultes polythéistes de l'Empire romain », Cahiers Evangile, Cerf, vol. Supplément, no 180, (ISSN0222-9714)