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Fils de Jacob, et de la descendante dei Meir Eisenstadt, sa femme est la fille de rabbin Yitzchok de Volozhin, fils de Haim de Volozhin puis sa seconde femme est sa nièce, fille du rabbin Yehiel Mihel Epstein, l'auteur de Aruch haShulchan.
Il a un fils, Chaim Berlin, futur rabbin de Moscou, une fille mariée au rabbin Refael Shapiro. De sa seconde épouse, il a un fils, Meir Bar-Ilan.
(en) B. Epstein, Mekor Baruch, in My Uncle the Netziv par Rabbi M. Dombey. Brooklyn, New York: Mesorah publications ltd. (ISBN0-89906-493-0)
(en) Gil S. Perl, The Pillar of Volozhin : Rabbi Naftali Ẓvi Yehuda Berlin and the world of nineteenth-century Lithuanian Torah scholarship, Brighton (Mass.), Academic Studies Press, 2012. (ISBN978-1-936235-70-4)
(en) Gil S. Perl, No Two Minds are Alike”: Tolerance and Pluralism in the Work of Netziv, in Torah U-Maddaj Journal, vol. 12