Les Protobranches, ou sous-classe des Protobranchia Pelseneer, 1889, sont un taxon de bivalves proches des gastéropodes. Ils possèdent une charnière taxodonte et sont dimyaires. Il y a deux ordres.
Selon World Register of Marine Species (18 avril 2016)[1] :
- ordre Afghanodesmatida Carter, 2011 †
- ordre Nuculanida Carter, J. G., Campbell, D. C. & M. R. Campbell, 2000
- super-famille Nuculanoidea H. Adams & A. Adams, 1858 (1854)
- famille Cucullellidae P. Fischer, 1886 †
- famille Isoarcidae Keen, 1969 †
- famille Lametilidae Allen & Sanders, 1973
- famille Malletiidae H. Adams & A. Adams, 1858 (1846)
- famille Neilonellidae Schileyko, 1989
- famille Nuculanidae H. Adams & A. Adams, 1858 (1854)
- famille Phaseolidae Scarlato & Starobogatov, 1971
- famille Polidevciidae Kumpera, Prantl & Růžička, 1960 †
- famille Pseudocyrtodontidae Maillieux, 1939 †
- famille Siliculidae Allen & Sanders, 1973
- famille Strabidae Prantl & Růžička, 1954 †
- famille Tindariidae Verrill & Bush, 1897
- famille Yoldiidae Dall, 1908
- ordre Nuculida Dall, 1889
- ordre Solemyida Dall, 1889
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