Pyruvate déshydrogénase phosphatase

Pyruvate déshydrogénase phosphatase
N° EC EC 3.1.3.43
N° CAS 9073-70-5
Activité enzymatique
IUBMB Entrée IUBMB
IntEnz Vue IntEnz
BRENDA Entrée BRENDA
KEGG Entrée KEGG
MetaCyc Voie métabolique
PRIAM Profil
PDB RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
GO AmiGO / EGO

modifier

La pyruvate déshydrogénase phosphatase est une hydrolase qui catalyse la réaction :

pyruvate déshydrogénase–phosphate + H2O    pyruvate déshydrogénase + phosphate.

Cette enzyme intervient dans l'activation de la pyruvate déshydrogénase, composante E1 du complexe pyruvate déshydrogénase. En effet, les pyruvate déshydrogénase kinases catalysent la phosphorylation de résidus de sérine sur cette enzyme pour former des résidus de O-phosphosérine qui l'inactivent, et inactivent ainsi le complexe enzymatique dans son ensemble ; la pyruvate déshydrogénase phosphatase catalyse la déphosphorylation de cette enzyme, ce qui a pour effet de lever l'inactivation. Tout comme le complexe pyruvate déshydrogénase et les pyruvate déshydrogénase kinases, cette enzyme est localisée dans la matrice mitochondriale.

Il s'agit d'une protéine hétérodimérique formée d'une unité catalytique et d'une unité régulatrice. Deux variantes de la sous-unité catalytique ont été identifiées : l'une est exprimée majoritairement dans les muscles squelettiques tandis que l'autre est sensiblement plus abondante dans le foie.

Notes et références

[modifier | modifier le code]
  • (en) Piccinini M, Mostert M, Alberto G, Cristina Ramondetti, Rosa F. Novi, Paola Dalmasso et Maria T. Rinaudo, « Down-regulation of pyruvate dehydrogenase phosphatase in obese subjects is a defect that signals insulin resistance », Obes. Res., vol. 13, no 4,‎ , p. 678–86 (PMID 15897476, DOI 10.1038/oby.2005.76)
  • (en) Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, T Ota, T Nishikawa, R Yamashita, J Yamamoto, M Sekine et K Tsuritani, « Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes », Genome Res., vol. 16, no 1,‎ , p. 55–65 (PMID 16344560, PMCID 1356129, DOI 10.1101/gr.4039406)
  • (en) Hu RM, Han ZG, Song HD, YD Peng, QH Huang, SX Ren, YJ Gu, CH Huang et YB Li, « Gene expression profiling in the human hypothalamus-pituitary-adrenal axis and full-length cDNA cloning », Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 97, no 17,‎ , p. 9543–8 (PMID 10931946, PMCID 16901, DOI 10.1073/pnas.160270997)
  • (en) Auffray C, Behar G, Bois F, C Bouchier, C Da Silva, MD Devignes, S Duprat, R Houlgatte et MN Jumeau, « [IMAGE: molecular integration of the analysis of the human genome and its expression] », C. R. Acad. Sci. III, Sci. Vie, vol. 318, no 2,‎ , p. 263–72 (PMID 7757816)
  • (en) Lejeune F, Li X, Maquat LE, « Nonsense-mediated mRNA decay in mammalian cells involves decapping, deadenylating, and exonucleolytic activities », Mol. Cell, vol. 12, no 3,‎ , p. 675–687 (PMID 14527413, DOI 10.1016/S1097-2765(03)00349-6)
  • (en) Cameron JM, Maj M, Levandovskiy V, C. P. Barnett, S. Blaser, N. MacKay, J. Raiman, A. Feigenbaum et A. Schulze, « Pyruvate dehydrogenase phosphatase 1 (PDP1) null mutation produces a lethal infantile phenotype », Hum. Genet., vol. 125, no 3,‎ , p. 319–26 (PMID 19184109, DOI 10.1007/s00439-009-0629-6)
  • (en) Maj MC, MacKay N, Levandovskiy V, J Addis, ER Baumgartner, MR Baumgartner, BH Robinson et JM Cameron, « Pyruvate dehydrogenase phosphatase deficiency: identification of the first mutation in two brothers and restoration of activity by protein complementation », J. Clin. Endocrinol. Metab., vol. 90, no 7,‎ , p. 4101–7 (PMID 15855260, DOI 10.1210/jc.2005-0123)
  • (en) Sugden MC, Holness MJ, « Recent advances in mechanisms regulating glucose oxidation at the level of the pyruvate dehydrogenase complex by PDKs », Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab., vol. 284, no 5,‎ , E855–62 (PMID 12676647, DOI 10.1152/ajpendo.00526.2002)
  • (en) Kato J, Kato M, « Crystallization and preliminary crystallographic studies of the catalytic subunits of human pyruvate dehydrogenase phosphatase isoforms 1 and 2 », Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun., vol. 66, no Pt 3,‎ , p. 342–345 (PMID 20208177, PMCID 2833053, DOI 10.1107/S1744309110003131)
  • (en) Korotchkina LG, Patel MS, « Mutagenesis studies of the phosphorylation sites of recombinant human pyruvate dehydrogenase. Site-specific regulation », J. Biol. Chem., vol. 270, no 24,‎ , p. 14297–304 (PMID 7782287, DOI 10.1074/jbc.270.24.14297)
  • (en) Stellingwerff T, Spriet LL, Watt MJ, NE Kimber, M Hargreaves, JA Hawley et LM Burke, « Decreased PDH activation and glycogenolysis during exercise following fat adaptation with carbohydrate restoration », Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab., vol. 290, no 2,‎ , E380–8 (PMID 16188909, DOI 10.1152/ajpendo.00268.2005)
  • (en) Ito M, Kobashi H, Naito E, T Saijo, E Takeda, AH Huq et Y Kuroda, « Decrease of pyruvate dehydrogenase phosphatase activity in patients with congenital lactic acidemia », Clin. Chim. Acta, vol. 209, nos 1–2,‎ , p. 1–7 (PMID 1327585, DOI 10.1016/0009-8981(92)90327-M)
  • (en) Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, RA Fuldner, CJ Bult, NH Lee, EF Kirkness, KG Weinstock et JD Gocayne, « Initial assessment of human gene diversity and expression patterns based upon 83 million nucleotides of cDNA sequence », Nature, vol. 377, no 6547 Suppl,‎ , p. 3–174 (PMID 7566098)
  • (en) Caruso M, Maitan MA, Bifulco G, C Miele, G Vigliotta, F Oriente, P Formisano et F Beguinot, « Activation and mitochondrial translocation of protein kinase Cdelta are necessary for insulin stimulation of pyruvate dehydrogenase complex activity in muscle and liver cells », J. Biol. Chem., vol. 276, no 48,‎ , p. 45088–97 (PMID 11577086, DOI 10.1074/jbc.M105451200)
  • (en) Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, CM Shenmen, LH Grouse, G Schuler, SL Klein, S Old et R Rasooly, « The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) », Genome Res., vol. 14, no 10B,‎ , p. 2121–7 (PMID 15489334, PMCID 528928, DOI 10.1101/gr.2596504)
  • (en) Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, Tetsuji Otsuki, Tomoyasu Sugiyama, Ryotaro Irie, Ai Wakamatsu, Koji Hayashi et Hiroyuki Sato, « Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs », Nat. Genet., vol. 36, no 1,‎ , p. 40–5 (PMID 14702039, DOI 10.1038/ng1285)
  • (en) Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB, « Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery », Genome Res., vol. 6, no 9,‎ , p. 791–806 (PMID 8889548, DOI 10.1101/gr.6.9.791)
  • (en) Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, JG Derge, RD Klausner, FS Collins, L Wagner, CM Shenmen et GD Schuler, « Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences », Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 99, no 26,‎ , p. 16899–903 (PMID 12477932, PMCID 139241, DOI 10.1073/pnas.242603899)
  • (en) Huang B, Gudi R, Wu P, RA Harris, J Hamilton et KM Popov, « Isoenzymes of pyruvate dehydrogenase phosphatase. DNA-derived amino acid sequences, expression, and regulation », J. Biol. Chem., vol. 273, no 28,‎ , p. 17680–8 (PMID 9651365, DOI 10.1074/jbc.273.28.17680)