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Connu depuis son ouvrage Europe, la voie romaine[1], paru en 1992, ainsi que pour ses essais sur la religionchrétienne, ses recherches actuelles relèvent de l'histoire des idées à très long terme et de la comparaison entre christianisme, judaïsme et islam.
Son domaine d'étude est très vaste : bien qu'officiellement spécialiste des philosophies médiévalesjuive et arabe, il a d'abord travaillé sur la philosophie grecque ; d'abord sur Platon, puis sur Aristote[11]. Sa thèse de 3e cycle portait sur le Ménon de Platon (publiée sous le titre Le Restant). Sa thèse de doctorat d'État est une étude sur la notion de monde chez Aristote. C'est ensuite que sa recherche s'est tournée sur le Moyen Âge arabe, juif et latin. Il a publié sur saint Bernard, Razi et Maïmonide. Rémi Brague est aussi un commentateur de l'œuvre de Heidegger et un spécialiste de Leo Strauss[12].
L'ouvrage qui l'a fait sortir du cadre de l'expertise philosophique érudite est Europe, la voie romaine[13], traduit en plusieurs langues. Son travail actuel se développe en un triptyque qui concerne d'abord la représentation de la notion de monde (La Sagesse du monde)[14], ensuite la manière dont la pensée s'est représentée historiquement la loi de Dieu (la Loi de Dieu) ; le troisième volume (Le Règne de l'homme) porte sur les manières dont l'homme a cherché historiquement à s'émanciper de la nature et de Dieu.
Le Restant : supplément aux commentaires du Ménon de Platon, Paris, Vrin/Les Belles Lettres, 1978, 247 p. - 2e éd. inchangée, Vrin, 1999
Du temps chez Platon et Aristote : quatre études, PUF, Paris, 1982, 181 p. - 2e éd. inchangée, 1995
Aristote et la question du monde : essai sur le contexte cosmologique et anthropologique de l'ontologie, Paris, PUF, 1988, 560 p.
Europe, la voie romaine, Criterion, Paris, 1992, 189 p. - 2e éd. revue et augmentée, ib., 1993, 206 p. - 3e éd. revue et augmentée, coll. « Folio essais », NRF, Paris, 1999, 260 p. (ISBN978-2070408771)
Evropa, římská cesta, traduction tchèque par K. Thein. Prague, Karlova univerzita, 1994
Европа, римский путь/ traduction russe par A. M. Routkevitch А.М. Руткевич. Moscou, Аллегро-Пресс, 1995. 176 p.
Europa, droga rzymska, traduction polonaise par Wiktor Dłuski, Teologia Polityczna[23], Varsovie, Wyd. Funadcja Św. Mikołaja, 2012
Ekscentriškoji Europos tapatybė, traduction lituanienne par R. Matuzevičiūtė et K. Kazakevičiūtė. Vilnius, Aidai, 2001
La Sagesse du monde : histoire de l'expérience humaine de l'univers, Le Livre de Poche, coll. « Biblio Essais », , 445 p. (ISBN978-2-253-94322-8)
Pasaulio išmintis, traduction lituanienne par J. Žalgaitė-Kaya, Vilnius, Aidai, 2005
El passat per endavant [recueil inédit en français], traduction en catalan par J. Galí y Herrera, Barcelone, Barcelonesa d’edicions, 2001, 184 p.
Introduction au monde grec : études d'histoire de la philosophie, Éditions de la Transparence, 2005
La Loi de Dieu : Histoire philosophique d'une alliance, Folio, coll. « Folio essais », , 582 p. (ISBN978-2-07-035790-1)
Au moyen du Moyen Âge : Philosophies médiévales en chrétienté, judaïsme et islam, Paris, Flammarion, coll. « Champs essais », (réimpr. 2008), 433 p. (ISBN2-08-121785-6)
Du Dieu des chrétiens et d’un ou deux autres, Flammarion, 2008 (ISBN2081213192)
Image vagabonde. Essai sur l'imaginaire baudelairien, Éditions de La Transparence, 2008
Sur l'islam, Paris, Gallimard, coll. « L'esprit de la cité », 2023 (ISBN9782072855504), présentation sur le site de l'éditeur [lire en ligne]
La morale remise à sa place, Paris, Gallimard, coll. « L'esprit de la cité », 2024, (ISBN2073075770), présentation sur le site de l'éditeur [lire en ligne]
Herméneutique et ontologie, Mélanges en l'honneur de P. Aubenque à l'occasion de son 60e anniversaire, sous la dir. de Rémi Brague et Jean-François Courtine, PUF, Paris, 1990, XXI-388 p.
Saint Bernard et la Philosophie, PUF, Paris, 1993, 195 p.
Die Macht des Wortes, Eranos, N.F., Bd. 4, Wilhelm Fink, Munich, 1996, 347 p.
Leo Strauss, Maïmonide. Essais recueillis et traduits, Paris, PUF, 1988, 376 p.
Maïmonide, Traité de logique, Paris, DDB, 1996, 158 p.
Shlomo Pinès, La Liberté de philosopher. De Maïmonide à Spinoza, DDB, Paris, 1997, 484 p.
Thémistios, Paraphrase de la Métaphysique d'Aristote, Livre Lambda, Paris, Vrin, coll. « Tradition de la pensée antique », 1999, 175 p. (ISBN978-2711614110)
Maïmonide, Traité d'éthique, Paris, DDB, 2001, 186 p.
« La "voie romaine" », Vingtième siècle, revue d’histoire, no 71, , p. 63-66 (lire en ligne, consulté le )
« En marge de La Pharmacie de Platon de J. Derrida », Revue philosophique de Louvain, t. 71, Quatrième série, no 10, , p. 271-277 (lire en ligne, consulté le )
« Du théologico-politique au "théio-pratique" », Anglophonia, Caliban, no 17, , p. 7-11 (lire en ligne, consulté le )
↑« Prix décernés par l'Association », Revue des Études Grecques, Persée - Portail des revues scientifiques en SHS, vol. 105, no 502, , p. 7–8 (lire en ligne, consulté le ).