Originaire de la région d'Enugu, dans le Sud du Nigéria[2], il est né en 1945 ou 1946[1] selon les sources. Certaines biographies affirment qu'il a étudié le cinéma en Russie avant de revenir au Nigéria dans les années 1970[3]. Il publie un premier album intitulé Crashes in Love en 1977 sur son propre label Wilfilm Records[4]. Huit disques suivront jusqu'en 1985[5].
Il se retire ensuite de la musique, retourne dans sa région natale et se consacre à la religion[6], alors que d'autres biographies affirment qu'il serait devenu chef de son village et entrepreneur[7].
Quelques-uns de ses titres apparaissent sur des compilations publiées dans le courant des années 2000[8] telles que World Psychedelic Classics 3: Love's a Real Thing - The Funky Fuzzy Sounds of West Africa[9] ou Nigeria 70: The Definitive Story of 1970's Funky Lagos[10]. Le musicien Daphni sample le titre When the Going Is Smooth & Good, extrait de l'album Anything You Sow, pour son titre Ye Ye présent sur son album Jiaolong publié en 2011[11]. En 2013, le label Luaka Bop de David Byrne[12] publie une compilation de ses titres sous le nom de Who Is William Onyeabor?[13]. Cette même année, il fait l'objet d'un court documentaire diffusé sur Internet et intitulé Fantastic Man[14].
Onyeabor décède le dans sa maison d'Enugu au Nigéria[15].