ARNr 28S

Filoxenias dos ADN ribosómico 28S nuclear e do 16S mitocondrial de tres especies de moluscos pertencentes o xénero Waldo.

O ARNr 28S (ou 28S rRNA) é un tipo de ARN ribosómico cun coeficiente de sedimentación de 28 uniddes svedberg (28S) que é un compoñente estrutural da subunidade maior do ribosoma citosólico eucariota, polo que está presente en todas as células eucariotas.[1] É o homólogo eucariota nuclear do ARNr 23S procariota.[2]

Uso en filoxenia

[editar | editar a fonte]

Os xenes que codifican o ARNr 28S denomínanse ADNr 28S (ou 28S rDNA). A comparación das secuencias destes xenes utilízase ás veces en análises moleculares para construír árbores filoxenéticas, por exemplo en protistas,[3] fungos,[4] insectos,[5] tardígrados,[6] e vertebrados.[7][8]

Bases de datos

[editar | editar a fonte]

Existen varias bases de datos que proporcionan aliñamentos e anotacións de secuencias dos ARNr da subunidade maior ribosómica (LSU) con fins comparativos:

  • RDP,[9] o Ribosomal Database Project;[10][11]
  • SILVA, un proxecto de base de datos de xenes de ARN ribosómico.[12]

Notas

[editar | editar a fonte]
  1. ↑ Lodish, Harvey F.; Darnell, James E. (1995-01-01). Molecular cell biology. Scientific American Books. ISBN 978-0716723806. OCLC 30783343. 
  2. ↑ Eperon, I. C.; Anderson, S.; Nierlich, D. P. (1980-07-31). "Distinctive sequence of human mitochondrial ribosomal RNA genes". Nature (en inglés) 286 (5772): 460–467. doi:10.1038/286460a0. 
  3. ↑ Baroin, A.; Perasso, R.; Qu, L. H.; Brugerolle, G.; Bachellerie, J. P.; Adoutte, A. (1988-05-01). "Partial phylogeny of the unicellular eukaryotes based on rapid sequencing of a portion of 28S ribosomal RNA". Proceedings of the National Academy of Sciences (en inglés) 85 (10): 3474–3478. ISSN 0027-8424. PMC 280234. PMID 3368456. doi:10.1073/pnas.85.10.3474. 
  4. ↑ James, Timothy Y.; Kauff, Frank; Schoch, Conrad L.; Matheny, P. Brandon; Hofstetter, Valérie; Cox, Cymon J.; Celio, Gail; Gueidan, Cécile; Fraker, Emily (2006). "Reconstructing the early evolution of Fungi using a six-gene phylogeny". Nature 443 (7113): 818–822. PMID 17051209. doi:10.1038/nature05110. 
  5. ↑ Whiting, Michael F.; Carpenter, James C.; Wheeler, Quentin D.; Wheeler, Ward C. (1997-03-01). "The Strepsiptera Problem: Phylogeny of the Holometabolous Insect Orders Inferred from 18S and 28S Ribosomal DNA Sequences and Morphology". Systematic Biology (en inglés) 46 (1): 1–68. ISSN 1063-5157. PMID 11975347. doi:10.1093/sysbio/46.1.1. 
  6. ↑ Jørgensen, Aslak; Faurby, Søren; Hansen, Jesper G.; Møbjerg, Nadja; Kristensen, Reinhardt M. (2010-03-01). "Molecular phylogeny of Arthrotardigrada (Tardigrada)". Molecular Phylogenetics and Evolution 54 (3): 1006–1015. PMID 19822216. doi:10.1016/j.ympev.2009.10.006. 
  7. ↑ Le, Hoc Lanh Vân; Lecointre, Guillaume; Perasso, Roland (1993-03-01). "A 28S rRNA-Based Phylogeny of the Gnathostomes: First Steps in the Analysis of Conflict and Congruence with Morphologically Based Cladograms". Molecular Phylogenetics and Evolution 2 (1): 31–51. PMID 8081546. doi:10.1006/mpev.1993.1005. 
  8. ↑ Mallatt, Jon; Sullivan, Jack (December 1998). "28S and 18S rDNA sequences support the monophyly of lampreys and hagfishes". Molecular Biology and Evolution 15 (12): 1706–18. PMID 9866205. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a025897. 
  9. ↑ "Ribosomal Database Project". RDP Release 11, Update 5. September 30, 2016. Arquivado dende o orixinal o 19 de agosto de 2020. Consultado o 2016-12-31. 
  10. ↑ Olsen, G. J.; Overbeek, R.; Larsen, N.; Marsh, T. L.; McCaughey, M. J.; Maciukenas, M. A.; Kuan, W.-M.; Macke, T. J.; Xing, Y. (1992-05-11). "The Ribosomal Database Project". Nucleic Acids Research 20 (suppl): 2199–2200. ISSN 0305-1048. PMC 333993. doi:10.1093/nar/20.suppl.2199. 
  11. ↑ Cole, James R.; Wang, Qiong; Fish, Jordan A.; Chai, Benli; McGarrell, Donna M.; Sun, Yanni; Brown, C. Titus; Porras-Alfaro, Andrea; Kuske, Cheryl R. (2014-01-01). "Ribosomal Database Project: data and tools for high throughput rRNA analysis". Nucleic Acids Research 42 (D1): D633–D642. ISSN 0305-1048. PMC 3965039. PMID 24288368. doi:10.1093/nar/gkt1244. 
  12. ↑ Quast, C.; Pruesse, E.; Yilmaz, P.; Gerken, J.; Schweer, T.; Yarza, P.; Peplies, J.; Glockner, F. O. (2013-01-01). "The SILVA ribosomal RNA gene database project: improved data processing and web-based tools". Nucleic Acids Research 41 (D1): D590–D596. ISSN 0305-1048. PMC 3531112. PMID 23193283. doi:10.1093/nar/gks1219. 
Este artigo tan só é un bosquexo
 Este artigo sobre bioloxía é, polo de agora, só un bosquexo. Traballa nel para axudar a contribuír a que a Galipedia mellore e medre.
 Existen igualmente outros artigos relacionados con este tema nos que tamén podes contribuír.