ताजिकिस्तान स्वास्थ्य प्रणाली पूर्व सोवियत विरासत से प्रभावित है। यह डब्ल्यूएचओ यूरोपीय क्षेत्र के भीतर सबसे गरीब देश के रूप में रैंक किया गया है, जिसमें प्रति व्यक्ति सबसे कम स्वास्थ्य व्यय शामिल है। ताजिकिस्तान 2016 में 0.627 के सूचकांक के साथ 188 देशों के मानव विकास सूचकांक में 129 वें स्थान पर है।[1] 2016 में, SDG सूचकांक मूल्य 56 था। ताजिकिस्तान में शिशु और मातृ मृत्यु दर जैसे स्वास्थ्य संकेतक पूर्व सोवियत गणराज्यों में सबसे अधिक हैं। सोवियत काल के बाद में, खराब पोषण, प्रदूषित जल आपूर्ति और हैजा, मलेरिया, तपेदिक और टाइफाइड की बढ़ती घटनाओं के कारण जीवन प्रत्याशा में कमी आई है। क्योंकि स्वास्थ्य देखभाल प्रणाली बुरी तरह से खराब हो गई है और अपर्याप्त धन प्राप्त करता है और क्योंकि स्वच्छता और पानी की आपूर्ति प्रणाली में गिरावट की स्थिति है, ताजिकिस्तान में महामारी की बीमारी का उच्च जोखिम है।[2]
स्वतंत्रता के बाद के वर्षों (1991 में प्राप्त) जनसंख्या की स्वास्थ्य स्थिति के महत्वपूर्ण गिरावट के साथ जुड़े थे। यह दोनों संचारी और गैर-संचारी रोगों में वृद्धि और स्वास्थ्य सेवाओं में गिरावट से प्रेरित था 1950 और 2015 के बीच ताजिकिस्तान के लिए "जनसंख्या वृद्धि और क्रूड डेथ और जन्म दर" का आंकड़ा जन्म (बायीं धुरी) और कुल प्रजनन दर (सही अक्ष) पर जीवन प्रत्याशा में रुझान दिखाता है।[3] 1960 और 1980 के दशक के उत्तरार्ध के बीच जीवन प्रत्याशा में लगातार वृद्धि हुई। हालांकि, पुरुषों के लिए जीवन प्रत्याशा में गिरावट आई और स्वतंत्रता और गृह युद्ध के बाद की अवधि के दौरान महिलाओं के लिए याचिका दायर की गई। 1990 के दशक के उत्तरार्ध में दोनों समूहों के लिए जीवन प्रत्याशा फिर से बढ़ने लगी, पुरुषों के लिए 66 और 2014 तक महिलाओं के लिए 73। 1960 और 1970 के बीच कुल प्रजनन दर बढ़ रही थी, जो प्रति महिला 6.9 बच्चों तक पहुँच रही थी।[4] इस समय के बाद, प्रजनन क्षमता घटने लगी, 2016 तक प्रति महिला 3.4 बच्चे तक पहुंच गई। "1960 और 2014 के बीच ताजिकिस्तान में जन्म और जीवन की कुल प्रजनन दर में रुझान" की जनसंख्या का आंकड़ा "जनसंख्या वृद्धि (दायां अक्ष) और क्रूड डेथ रेट और क्रूड जन्म दर (लेफ्ट एक्सिस) दर्शाता है। 1950 से जनसंख्या वृद्धि लगातार बढ़ी है। इस अवधि के दौरान क्रूड डेथ रेट में धीरे-धीरे गिरावट आई है जबकि क्रूड जन्म दर में तेजी से और अधिक परिवर्तनशीलता के साथ गिरावट आई है। 1990 में, मृत्यु का प्रमुख कारण संचारी रोग (मुख्य रूप से दस्त और कम श्वसन संक्रमण) थे। 2013 तक, मृत्यु के प्रमुख कारण गैर-संचारी रोग (मुख्य रूप से स्ट्रोक और इस्केमिक हृदय रोग) थे। ताजिकिस्तान में प्रमुख स्वास्थ्य जोखिम कारक आहार जोखिम है।