Diaphoretickes

Diaphoretickes
Rendszertani besorolás
Domén: Eukarióták (Eukaryota)
Csoport: Diaphoretickes
Adl et al. 2012[1]
Szinonimák

Corticata

Csoportok
Hivatkozások
Commons
Commons

A Wikimédia Commons tartalmaz Diaphoretickes témájú kategóriát.

A Diaphoretickes több mint 400 000 fajt tartalmazó eukarióta csoport. A Föld fotoszintetikus biomasszájának többsége ide tartozik.[2]

Filogenetika

[szerkesztés]

2012-ben a Diaphoretickest az alábbi filogenetikai definícióval határozták meg:

A Bigelowiella natans Moestrup et Sengco 2001 (Rhizaria), Tetrahymena thermophila Nanney et McCoy 1976 (Alveolata), Thalassiosira pseudonana Cleve 1873 (Stramenopila) és Arabidopsis thaliana (Linnaeus) Heynhold, 1842 (Archaeplastida) fajokat tartalmazó, de a Homo sapiens Linnaeus 1758 (Opisthokonta), Dictyostelium discoideum Raper 1935 (Amoebozoa) vagy Euglena gracilis Klebs 1883 (Excavata) fajokat nem tartalmazó legbővebb klád. Ez elágazásalapú definíció, ahol minden csomópont élő.[1]

A Hemimastigophora besorolása ismeretlen. Egyes tanulmányok szerint a Diaphoretickes kládjain belül van mint leginkább[3] vagy kevésbé alátámasztott hipotézis.[4] Mások szerint az összes többi tag testvére,[4] így az elágazásalapú definíció alapján a Diaphoretickes tagja.[1]

Az alábbi csoportokat tartalmazza:

Diaphoretickes


Hemimastigophora




Provora




Haptista


Tsar

Telonemia


Sar

Rhizaria


Halvaria

Stramenopila



Alveolata








CAM


Cryptista



Microheliella maris




Archaeplastida




Taxonómiai történet

[szerkesztés]

A Diaphoretickest először Burki et al. (2008) azonosították a „növények+Hc+Sar megacsoportként”,[5] mivel részei a növények (Archaeplastida), a Haptophyta, a Cryptomonada és a Stramenopila, az Alveolata és a Rhizaria. A Diaphoretickest nevezték Sar/Ha szupercsoportnak vagy „Corticatának a Rhizariával” is.[6] E leírás alapján a legtöbb fotoszintetikus fajt, kivéve az ostoros moszatokat (Euglenozoa) és a cianobaktériumokat. Minden nem az Excavata csoportba tartozó bikontot tartalmaz a Hemimastigophorával együtt. A Corticata név Thomas Cavalier-Smith hipotéziséről kapta a nevét a Glaucophyta és az Alveolata kortikális alveolusainak közös eredetéről.[7] The megagroup was previously described as the sum of Archaeplastida, Rhizaria, and chromalveolates.[8] Azonban ez elavult, elsősorban azon felfedezés révén, hogy a Chromalveolata, a Chromista finomítása nem monofiletikus.[9][10]

A taxon neve a görög διαφορετικές (különböző nemű) szóból ered, utalva a csoport morfológiai és sejttani jellemzői sokszínűségére.[1]

Genetika

[szerkesztés]

A-családbeli DNS-polimerázok

[szerkesztés]

2024-ben Harada et al. a Guillardia theta DNS-polimeráz A-ja GFP-vel egyesített N-terminális részét hozták létre a Phaeodactylum tricornutum modellkovamoszatban.[11] Az így keletkező zöld fluoreszcenciajel a plasztisz autofluoreszcenciájával átfed, vagyis a G. theta DNS-polimeráz A-ja plasztiszcélzó jel a kovamoszatokban. Ez összefügg a G. theta cryptoPolA N-terminális szekvenciajellemzőivel – e fehérje jelzőpeptidet tartalmaz. A feltételezett elválasztási helytől 5 aminosavra van benne fenilalanin.[11] A cryptoPolA feltehetően az Alphaproteobacteria egyik baktériumából származik.[11]

A Chlorophyceae 27 faja és a Pyramimonadales is tartalmaz DNS-polimeráz A-t, ezek neve chloroPolA, illetve pyramiPolA.[11] A 11 chloroPolA-szekvenciából 5 a zöldmoszatokban való fehérjehelyzet előrejelzésére készült PredAlgo alapján feltehetően mitokondriális.[11] A chloroPolA feltehetően cianobaktériumból származik, míg a pyramiPolA Gammaproteobacteria-fajból.[11]

Az abanPolA-t az Apusomonadida, a Breviatea és az Amoebozoa mellett a Nebulidia is tartalmazza, nevét e négy taxon nevének kezdőbetűjéből kapta. Feltehetően egy Planctomycetesbe tartozó baktériumtól származik.[11]

Az alvPolA az Alveolatában van, feltehetően a sejtmagban van, eredete ismeretlen.[11]

Genomváltozások

[szerkesztés]

Az Excavata és a Diaphoretickes és a Streptophyta elválása közt jelentős géncsaládvesztés, a szárazföldi növények diverzitásának növekedésekor pedig jelentős géncsaládfelvétel történt.[12] Ez egybeesik Bowles et al. 2020-as tanulmányának eredményeivel, mely az új gének számának jelentős növekedését mutatta ki a szárazföldi növények megjelenése idején.[13]

Jegyzetek

[szerkesztés]
  1. ↑ a b c d Adl SM, Simpson AG, Lane CE, Lukeš J, Bass D, Bowser SS, Brown MW, Burki F, Dunthorn M, Hampl V, Heiss A, Hoppenrath M, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, McManus H, Mitchell EA, Mozley-Stanridge SE, Parfrey LW, Pawlowski J, Rueckert S, Shadwick L, Shadwick L, Schoch CL, Smirnov A, Spiegel FW (2012. szeptember 1.). „The revised classification of eukaryotes”. The Journal of Eukaryotic Microbiology 59 (5), 429–493. o. DOI:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMID 23020233. PMC 3483872. 
  2. ↑ Bar-On YM, Phillips R, Milo R (2018. június 1.). „The biomass distribution on Earth”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 115 (25), 6506–6511. o. DOI:10.1073/pnas.1711842115. PMID 29784790. PMC 6016768. 
  3. ↑ Yazaki, Euki (2022). „The closest lineage of Archaeplastida is revealed by phylogenomics analyses that include Microheliella maris”. Open Biology 12 (210376), 210376. o. DOI:10.1098/rsob.210376. PMID 35414259. PMC 9006020. 
  4. ↑ a b Lax, Gordon (2018. november 14.). „Hemimastigophora is a novel supra-kingdom-level lineage of eukaryotes”. Nature 564 (7736), 410–414. o. DOI:10.1038/s41586-018-0708-8. PMID 30429611. 
  5. ↑ Burki F, Shalchian-Tabrizi K, Pawlowski J (2008. augusztus 1.). „Phylogenomics reveals a new 'megagroup' including most photosynthetic eukaryotes”. Biology Letters 4 (4), 366–369. o. DOI:10.1098/rsbl.2008.0224. PMID 18522922. PMC 2610160. 
  6. ↑ Cavalier-Smith T, Chao EE, Snell EA, Berney C, Fiore-Donno AM, Lewis R (2014. december 1.). „Multigene eukaryote phylogeny reveals the likely protozoan ancestors of opisthokonts (animals, fungi, choanozoans) and Amoebozoa”. Molecular Phylogenetics and Evolution 81, 71–85. o. DOI:10.1016/j.ympev.2014.08.012. PMID 25152275. 
  7. ↑ Cavalier-Smith T (2003. január 1.). „Protist phylogeny and the high-level classification of Protozoa”. European Journal of Protistology 39 (4), 338–348. o. DOI:10.1078/0932-4739-00002. 
  8. ↑ Hampl V, Hug L, Leigh JW, Dacks JB, Lang BF, Simpson AG, Roger AJ (2009. március 1.). „Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic "supergroups"”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 106 (10), 3859–3864. o. DOI:10.1073/pnas.0807880106. PMID 19237557. PMC 2656170. 
  9. ↑ Burki, Fabien (2008). „Phylogenomics reveals a new 'megagroup' including most photosynthetic eukaryotes”. Biology Letters 4 (4), 366–369. o. DOI:10.1098/rsbl.2008.0224. PMID 18522922. PMC 2610160. 
  10. ↑ Kim, E. (2008. július 1.). „EEF2 analysis challenges the monophyly of Archaeplastida and Chromalveolata”. PLOS ONE 3 (7), e2621. o. DOI:10.1371/journal.pone.0002621. PMID 18612431. PMC 2440802. 
  11. ↑ a b c d e f g h Harada R, Hirakawa Y, Yabuki A, Kim E, Yazaki E, Kamikawa R, Nakano K, Eliáš M, Inagaki Y (2024. február 1.). „Encyclopedia of Family A DNA Polymerases Localized in Organelles: Evolutionary Contribution of Bacteria Including the Proto-Mitochondrion”. Mol Biol Evol 41 (2), msae014. o. DOI:10.1093/molbev/msae014. PMID 38271287. PMC 10877234. 
  12. ↑ Domazet-Lošo M, Široki T, Šimičević K, Domazet-Lošo T (2024. március 26.). „Macroevolutionary dynamics of gene family gain and loss along multicellular eukaryotic lineages”. Nat Commun 15 (1), 2663. o. DOI:10.1038/s41467-024-47017-w. PMID 38531970. PMC 10966110. 
  13. ↑ Bowles AMC, Bechtold U, Paps J (2020. február 3.). „The Origin of Land Plants Is Rooted in Two Bursts of Genomic Novelty”. Curr Biol 30 (3), 530–536.e2. o. DOI:10.1016/j.cub.2019.11.090. PMID 31956023. (Hozzáférés: 2024. május 7.) 

Fordítás

[szerkesztés]
  • Ez a szócikk részben vagy egészben a Diaphoretickes című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.
  • Ez a szócikk részben vagy egészben a Diaphoretickes című német Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.

További információk

[szerkesztés]