Ֆենիլալանին-փՌՆԹ լիգազ
| Ֆենիլալանին-փՌՆԹ լիգազ | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Տեսակ | ֆերմենտների խումբ կամ դաս | ||||||||
| Ենթադաս | Լիգազներ[1] և aminoacyl tRNA synthetase? | ||||||||
| Բնորոշիչներ | |||||||||
| ՖՀ համար | |||||||||
| CAS համար | |||||||||
| Տվյալներ | |||||||||
| IntEnz | |||||||||
| BRENDA | |||||||||
| ExPASy | |||||||||
| KEGG | |||||||||
| MetaCyc | |||||||||
| PRIAM | |||||||||
| Protein Data Bank | |||||||||
| Գենի օնտոլոգիա | |||||||||
| |||||||||
| Ֆերոդոքսին-ծալված անտիկոդոն կապող դոմեյն | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||
| Տեսակ | ֆերմենտների խումբ կամ դաս | ||||||||
| Ենթադաս | Լիգազներ[1] և aminoacyl tRNA synthetase? | ||||||||
| Բնորոշիչներ | |||||||||
| Նշան | FDX-ACB | ||||||||
| Pfam | |||||||||
| InterPro | |||||||||
| SCOP | |||||||||
| SUPERFAMILY | |||||||||
| |||||||||
Ֆենիլալանին-փՌՆԹ լիգազ (ՖՀ 6.1.1.20), ֆերմենտ, որը կատալիզում է հետևյալ քիմիական ռեակցիան
- ԱԵՖ + L-ֆենիլալանին + փՌՆԹPhe ԱՄՖ + դիֆոսֆատ + L-ֆենիլալանիլ-փՌՆԹPhe
Այս ֆերմենտի երեք սուբստրատներն են ԱԵՖ, ֆենիլալանինը և փՌՆԹ(Phe), իսկ պրոդուկտներն են ԱՄՖ, դիֆոսֆատը և L-ֆենիլալանիլ-փՌՆԹPhe։
Այս ֆերմենտը պատկանում է այն լիգազների ենթադասին, որոնք ամինոացիլ-փՌՆԹ-ում առաջացնում են ածխածին-թթվածին կապեր։ Այս ֆերմենտի համակարգային անվանումն է L-ֆենիլալանին։ փՌՆԹPhe լիգազ (ԱՄՖ-առաջացնող)։ Այս ֆերմենտը մասնակցում է ֆենիլալանինի մետաբոլիզմին[2][3][4][5][6]։
Կառուցվածքի հետազոտություններ
[խմբագրել | խմբագրել կոդը]2007 թվականի դրությամբ հայնտի են այս ֆերմենտի 34 տարբեր կառուցվածքներ (1B70, 1B7Y, 1EIY, 1JJC, 1PYS, 2AKW, 2ALY, 2AMC, 2CXI, 2IY5)։
Ծանոթագրություններ
[խմբագրել | խմբագրել կոդը]- ↑ 1,0 1,1 ftp://ftp.expasy.org/databases/enzyme/enzyme.dat
- ↑ Mosyak L, Reshetnikova L, Goldgur Y, Delarue M, Safro MG (July 1995). «Structure of phenylalanyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus». Nat. Struct. Biol. 2 (7): 537–47. doi:10.1038/nsb0795-537. PMID 7664121.
{{cite journal}}: CS1 սպաս․ բազմաթիվ անուններ: authors list (link) - ↑ Goldgur Y, Mosyak L, Reshetnikova L, Ankilova V, Lavrik O, Khodyreva S, Safro M (January 1997). «The crystal structure of phenylalanyl-tRNA synthetase from thermus thermophilus complexed with cognate tRNAPhe». Structure. 5 (1): 59–68. doi:10.1016/s0969-2126(97)00166-4. PMID 9016717.
{{cite journal}}: CS1 սպաս․ բազմաթիվ անուններ: authors list (link) - ↑ Rodova M, Ankilova V, Safro MG (February 1999). «Human phenylalanyl-tRNA synthetase: cloning, characterization of the deduced amino acid sequences in terms of the structural domains and coordinately regulated expression of the alpha and beta subunits in chronic myeloid leukemia cells». Biochem. Biophys. Res. Commun. 255 (3): 765–73. doi:10.1006/bbrc.1999.0141. PMID 10049785.
{{cite journal}}: CS1 սպաս․ բազմաթիվ անուններ: authors list (link) - ↑ Moor N, Lavrik O, Favre A, Safro M (September 2003). «Prokaryotic and eukaryotic tetrameric phenylalanyl-tRNA synthetases display conservation of the binding mode of the tRNA(Phe) CCA end». Biochemistry. 42 (36): 10697–708. doi:10.1021/bi034732q. PMID 12962494.
{{cite journal}}: CS1 սպաս․ բազմաթիվ անուններ: authors list (link) - ↑ Klipcan L, Levin I, Kessler N, Moor N, Finarov I, Safro M (July 2008). «The tRNA-induced conformational activation of human mitochondrial phenylalanyl-tRNA synthetase». Structure. 16 (7): 1095–104. doi:10.1016/j.str.2008.03.020. PMID 18611382.
{{cite journal}}: CS1 սպաս․ բազմաթիվ անուններ: authors list (link)