Գենոմի փոփոխում, համարվում է գենային ինժեներիայի տեսակներից մեկը, որում կարելի է կատարել օրգանիզմի գենոմում ԴՆԹ-ի մասերի ավելացում, հեռացում կամ տեղափոխում՝ օգտագործելով հատուկ նախագծված էնդոնուկլեազները կամ «մոլեկուլյար մկրատը»։ Այդ նուկլեազները ստեղծում են ԴՆԹ-ի գենոմի կոնկրետ մասի երկկողմանի ճեղքավորում։ Ինդուկցված երկկողմանի ճեղքերը նորոգվում են ռեկոմբինացիայի պրոցեսի ժամանակ, ինչը թույլ է տալիս ստանալ մուտացիայի ուղղությունը։
Այդ մեթոդում օգտագործվում է 4 տիպի նուկլեազներ՝ մեգանուկլեազներ, նուկլեազներ՝ ցինկային մատիկներով (zinc fingers), TALEN նուկլեազներ և CRISPR-Cas համակարգ[1][2]։
2011 թվականին գենոմի փոփոխումը ճանաչվել է տարվա մեթոդ[3]։
2017 թվականի նոյեմբերին՝ Կալիֆոռնիայում աշխարհում առաջին անգամ տեղի ունեցավ հասուն մարդու գենոմի «փոփոխում»՝ հենց նրա մարմնի ներսում։ Պացիենտը մուկոպոլիսախարիդոզի II տիպով տղամարդ էր (Հանտերի համախտանիշ)[4][5]։