Ii Naotora (井伊 直虎 , d. 12 September 1582) (井伊 直虎, d. 12 oktober 1582) merupakan seorang daimyo dari periode Sengoku. Ia adalah putri tunggal Ii Naomori, kepala klan mereka yang kedelapan belas. Nama aslinya tidak diketahui.
Ii Naotora adalah putri Ii Naomori, yang merupakan pemimpin Iinoya-adalah bagian dari Tōtōmi. Tapi ia dikalahkan oleh Imagawa Yoshimoto dan menjadi pengikut Imagawa. Tidak ada pengganti laki-laki untuk keluarga Ii, jadi pamandanya Ii Naomitsu mencoba untuk menjodohkan putranya Ii Naochika dengannya agar ia dapat mewarisi klan tersebut. Namun, Naomitsu merencanakan pemberontakan ke Imagawa. Sebuah pemberontakan keluarg dengan laporan anonim dari pengikut klan Imagawa, Naomitsu dan Naochika diperintahkan untuk melakukan seppuku. Naomitsu meninggal, tapi Naochika masih sangat muda. Ia dilindungi oleh seorang pendeta Buddha bernama Nankei. Naochika berhasil melarikan diri ke Shinano. Sekitar sepuluh tahun kemudian, ia kembali ke Iinoya, tapi ia sudah menikahi wanita lain saat berada di pengasingan. Naotora menjadi imam, dan diberi nama Jiro Houshi oleh Nankei.
Naochika sejenak memerintah klan, tapi ia merencanakan pemberontakan ke Imagawa. Sebuah pemberontakan keluar oleh laporan anonim dan ia dibunuh oleh Imagawa Ujizane pada tahun 1560. Dikatakan bahwa ia dibunuh oleh penyebab laporan anonim Ono Michiyoshi. Setelah kematiannya dan banyak rintangan, Naotora kembali ke kehidupan sekuler dan menjadi kepala nominal klan. Ia bertarung dalam berbagai pertempuran bersama klan Tokugawa. Putra Naochika yang ia adopsi, Ii Naomasa yang terkenal, menggantikannya setelah kematiannya pada tahun 1582.
Ko Shibasaki memerankannya di drama NHK Taiga 2017 Onna Jōshu Naotora (おんな城主 直虎).
Ii Naotora muncul dalam video game Capcom Sengoku Basara 4 dan Sengoku Basara: Sanada Yukimura-Den, disuarakan oleh Maaya Sakamoto.
Ii Naotara muncul di video game Koei Tecmo Samurai Warriors 4, Dead or Alive 5 Last Round dan Warriors All-Stars, yang disuarakan oleh Yuka Saito.