Proteopedia

Proteopedia
Berkas:Proteopedia logo.gif
URLproteopedia.org
TipeEnsiklopedia daring
Bersifat komersial?Tidak
BahasaInggris
LisensiCreative Commons Atribusi-BerbagiSerupa 3.0 Tanpa Adaptasi Edit nilai pada Wikidata
Mesin perangkat lunakMediaWiki Edit nilai pada Wikidata
PembuatJoel L. Sussman, Eran Hodis, dan Jaime Prilusky
Berdiri sejak2007
Peringkat Alexa248.955 (30 November 2017) Edit nilai pada Wikidata
StatusPekerjaan abadi yang sedang berlangsung

Proteopedia adalah wiki, ensiklopedia 3D protein dan molekul lainnya.[1][2][3][4]

Situs web

[sunting | sunting sumber]

Situs ini berisi halaman untuk semua entri di Protein Data Bank (PDB), serta halaman yang lebih deskriptif tentang struktur protein secara umum seperti asetilkolinesterase,[5] hemoglobin,[6] dan Fotosistem II[7] dengan tampilan Jmol yang menyoroti situs fungsional dan ligan. Ini menggunakan alat pembuat adegan sehingga pengguna tidak perlu mempelajari bahasa skrip JSmol untuk membuat adegan molekuler yang disesuaikan. Adegan khusus dengan mudah dilampirkan ke "tautan hijau" dalam teks deskriptif yang menampilkan adegan tersebut di JSmol. Hanya browser web yang diperlukan untuk mengakses situs dan informasi 3D; tidak ada peneropong yang perlu dipasang.

Proteopedia adalah pemenang penghargaan tahun 2010 untuk situs web terbaik oleh majalah The Scientist.[8]

Ketentuan perizinan

[sunting | sunting sumber]

Semua konten yang ditambahkan pengguna, bebas dan dilindungi oleh Lisensi Dokumentasi Bebas GNU. Proteopedia diselenggarakan di Pusat Proteomik Struktural Israel,[9] Institut Sains Weizmann.

Referensi

[sunting | sunting sumber]
  1. ^ Hodis E, Prilusky J, Martz E, Silman I, Moult J, Sussman JL (2008). "Proteopedia - a scientific 'wiki' bridging the rift between three-dimensional structure and function of biomacromolecules". Genome Biol. 9 (8): R121. doi:10.1186/gb-2008-9-8-r121 alt=Dapat diakses gratis. PMC 2575511 alt=Dapat diakses gratis. PMID 18673581. 
  2. ^ Martz E (2009). "Proteopedia.Org: a scientific "Wiki" bridging the rift between 3D structure and function of biomacromolecules". Biopolymers. 92 (1): 76–7. doi:10.1002/bip.21126 alt=Dapat diakses gratis. PMID 19117028. 
  3. ^ Hodis E, Prilusky J, Sussman JL (2010). "Proteopedia: A collaborative, virtual 3D web-resource for protein and biomolecule structure and function". Biochemistry and Molecular Biology Education. 38 (5): 341–2. doi:10.1002/bmb.20431. PMID 21567857. 
  4. ^ Prilusky, J; Hodis, E.; Canner, D.; Decatur, W. A.; Oberholser, K.; Martz, E.; Berchanski, A.; Harel, M.; Sussman, J. L. (Aug 2011). "Proteopedia: A status report on the collaborative, 3D web-encyclopedia of proteins and other biomolecules". Journal of Structural Biology. 175 (2): 244–252. doi:10.1016/j.jsb.2011.04.011. PMID 21536137. 
  5. ^ "Acetylcholinesterase". Proteopedia. 
  6. ^ "Hemoglobin". Proteopedia. 
  7. ^ "Photosystem II". Proteopedia. 
  8. ^ Luiggi C (September 2010). "Web Gems Introducing the winners of the first annual Labbies, our prizes for the best web-based multimedia by labs: Website Winner:Proteopedia". The Scientist. 24 (9): 47. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2011-04-12. Diakses tanggal 2010-12-15. Very absorbing. Kept me looking and playing (and learning) with it for a long time. Very informative and a good resource. 
  9. ^ "The Israel Structural Proteomics Center". 12 November 2015. 

Pranala luar

[sunting | sunting sumber]