San Francisco adalah munisipalitas yang terletak di provinsi Cebu, Filipina.
Pada tahun 2007, munisipalitas ini memiliki populasi sebesar 44.588 jiwa.
Secara politis San Francisco terbagi menjadi 15 barangay, yaitu:
10°38′46″N 124°22′55″E / 10.646°N 124.382°E