Bianconi fu al centro di una polemica con lo scienziato cattolico evoluzionista Filippo De Filippi sulla validità delle teorie di Darwin.[3] Per Bianconi l'uomo non sarebbe potuto derivare da scimmie antropomorfe, ed avrebbe invece dovuto essere il risultato di una creazione indipendente, essendo distinto da tutti gli altri animali dall'intelligenza e dalla morale. [4]
Sul sistema vascolare delle foglie considerato come carattere distintivo per la determinazione delle filliti, del Dottor Giuseppe Bianconi. Bologna, Marsigli. (1838)[5]
Storia naturale dei terreni ardenti, dei vulcani fangosi. Bologna. (1840)
Specimina ZoologicaMosambicana, fasciculus IV, V. (Mollusca) Memorie della Accademia delle Scienze dell'Istituto di Bologna, volume 3, pages 3–18, 91-112, plate. (1850, 1851)
Repertorio Italiano per la Storia Naturale. Zoologiam, Mineralogiam, Geolgiam, Palaentologiam. Bologna. (1854)[5]
La Theorie Darwinienne et la creation dite independante (1874).
B. Veratti, Della vita e delle opere del prof. Giovanni Giuseppe Bianconi, Modena 1882;
G. B. Comelli, Elogio del prof. Giovanni Giuseppe Bianconi, Bologna 1882;
C. Fenizia, Storia della evoluzione, Milano 1901, pp. 340 s., 343.
Sarjeant, William A. S. 1980-96. Geologists and the history of geology: an international bibliography. 10 vols. including supplements. London: Macmillan. Florida: Krieger Publishing.