Watkins fu scelto dai Philadelphia Eagles nel corso del quarto giro del Draft 2014[1]. Debuttò come professionista subentrando nella vittoria della settimana 1 contro i Jacksonville Jaguars[2]. La sua prima stagione si chiuse con tre tackle in quattro presenze. Dopo una parentesi ai Buffalo Bills nella pre-stagione 2015, Watkins tornò agli Eagles e nel 2016 giocò per la prima volta tutte le 16 partite, 4 delle quali come titolare, mettendo a segno un nuovo primato personale di 32 tackle.