Joseph-François Malgaigne (Charmes, 14 febbraio 1806 – Saint-Gratien, 17 ottobre 1865) è stato un chirurgo francese.
Studiò medicina a Parigi e in seguito fu chirurgo degli ospedali parigini, compresi gli Hôpital Saint-Louis, Charité e Beaujon. All'Hôpital Saint-Louis fu un collega di Auguste Nélaton (1807-1873). Malgaigne fu il suocero del chirurgo Léon Clément Le Fort (1829-1893). Nel 1846 divenne membro dell'Académie de Médecine.
Malgaigne è noto per il suo lavoro sulle fratture e dislocazioni ossee, specializzato in chirurgia ortopedica per il ginocchio, anca e spalla. Nel 1834 pubblicò Manuel de medecine operatoire, un influente lavoro sulle tecniche chirurgiche. Questo libro fu successivamente tradotto in diverse lingue. Nel 1843 Malgaigne, insieme a Germanicus Mirault progettò una procedura di trasposizione del lembo per chiudere le labbra schisi.[1]
Come sostenitore dell'analisi statistica in medicina, fu ricordato per aver condotto indagini ospedaliere statistiche a Parigi. Come storico, fu uno studioso delle opere di Ippocrate e editore degli scritti di Ambroise Paré. Nel 1841 fu il fondatore della rivista chirurgica Journal de chirurgie.
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