McDuffie fu scelto nel primo giro del Draft 1992 dai Miami Dolphins[1]. Fu premiato come rookie dell'anno da Sports Illustrated e come rookie difensivo dell'anno da Football News dopo avere terminato con 84 tackle, 6 sack (terzo massimo di sempre per un rookie dei Dolphins) e un fumble forzato in 15 partite come titolare. Giocò per altri tre anni a Miami, poi ne disputò tre coi San Diego Chargers. Nel 1999 passò ai Washington Redskins con cui nel primo anno fu convocato per il suo unico Pro Bowl dopo avere fatto registrare 6,5 sack. L'anno successivo invece mise a segno un record personale di 12 sack. Passò le ultime stagioni della carriera con Jacksonville Jaguars (2002), Philadelphia Eagles (2003) e Denver Broncos (2004-2005).
^(EN) 1992 National Football League Draft, Pro Football Hall of Fame. URL consultato l'11 gennaio 2013 (archiviato dall'url originale il 1º novembre 2014).