ハイグロマイシンB
IUPAC命名法 による物質名
(3' R ,3aS ,4S ,4' R ,5' R ,6R ,6' R ,7S ,7aS )-4-{[(1R ,2S ,3R ,5S ,6R )-3-amino-2,6-dihydroxy-5-(methylamino)cyclohexyl]oxy}-6'-[(1S )-1-amino-2-hydroxyethyl]-6-(hydroxymethyl)-tetrahydro-3aH -spiro[[1,3]dioxolo[4,5-c]pyran-2,2'-oxane]-3',4',5',7-tetrol
臨床データ Drugs.com
国別販売名(英語) International Drug Names 識別 CAS番号
31282-04-9 ATCコード
none PubChem
CID: 35766 ChemSpider
32900 ChEMBL
CHEMBL1276484 別名
O -6-Amino-6-deoxy-L-glycero-D-galacto-heptopyranosylidene-(1-2-3)-O -β-D-talopyranosyl(1-5)-2-deoxy-N3 -methyl-D-streptamine 化学的データ 化学式 C 20 H 37 N 3 O 13 分子量 527.53 g/mol (563.5 with HCl)
O1[C@H]4[C@@H](OC12O[C@@H]([C@H](O)[C@@H](O)[C@H]2O)[C@@H](N)CO)[C@@H](O)[C@H](O[C@H]4O[C@@H]3[C@@H](O)[C@H](N)C[C@H](NC)[C@H]3O)CO
InChI=1S/C20H37N3O13/c1-23-7-2-5(21)9(26)15(10(7)27)33-19-17-16(11(28)8(4-25)32-19)35-20(36-17)18(31)13(30)12(29)14(34-20)6(22)3-24/h5-19,23-31H,2-4,21-22H2,1H3/t5-,6+,7+,8-,9+,10-,11+,12-,13-,14-,15-,16+,17+,18-,19+,20?/m1/s1 Key:GRRNUXAQVGOGFE-KPBUCVLVSA-N
物理的データ 融点 160 - 180 °C (320 - 356 °F) (decomp.) テンプレートを表示
ハイグロマイシンB (Hygromycin B) は、ストレプトマイセス属 の細菌 Streptomyces hygroscopicus によって産生される抗生物質 である。アミノグリコシド系 の抗生物質であり、タンパク質合成 を阻害することで、細菌、菌類 、高等真核生物 の細胞に作用する[ 1] 。
ハイグロマイシンBは、1950年代に動物に対する使用のために開発された抗生物質で、ブタやニワトリの飼料に駆虫薬 などとして添加されている(商品名: Hygromix)が、日本では現在用いられていない[ 2] 。ハイグロマイシンBは、1953年に土壌飼料から単離された細菌 Streptomyces hygroscopicus によって産生される。耐性遺伝子 は1980年代初頭に発見された[ 3] [ 4] 。
ハイグロマイシンは、原核生物 の細胞・真核生物 の細胞の両方に対して活性があり、ポリペプチド の合成を阻害することによって機能する。ハイグロマイシンはリボソーム のトランスロケーションを阻害することによって翻訳 を阻害する[ 5] 。
研究室においてハイグロマイシンは、ハイグロマイシン耐性遺伝子を持つ細胞を選択・維持するために用いられる。ハイグロマイシン耐性遺伝子は、ハイグロマイシンBをリン酸化 によって不活性化するキナーゼ である[ 6] 。ハイグロマイシン耐性遺伝子の発見以来、ハイグロマイシンBは原核生物や真核生物の細胞での遺伝子導入実験における標準的な選択性抗生物質となっている。不純物のモニタリングによって[ 7] 、異なるサプライヤーから販売されているハイグロマイシンBに4種類の異なる不純物が発見されている。異なる不純物による細胞系への毒性について、下の外部リンクでは記述されている。
ハイグロマイシン耐性遺伝子は、植物 の研究において選択マーカー として頻繁に用いられる。アグロバクテリウム を用いたイネ の形質転換では、ハイグロマイシンが、30–75 mg/L、平均して 50 mg/L 程度の濃度で用いられる。50 mg/L のハイグロマイシンは形質転換されていないカルス にとっては非常に毒性が高く、そのため効率的に形質転換体を選択することができる。
^ McGuire, Pettinger (1953), “Hygromycin I. Preliminary studies on the production and biological activity of a new antibiotic.”, Antibiot. Chemother. 3 : 1268–1278
^ 山本 ライン (2017). “動物用抗菌性物質を取り巻く現状(9)飼料添加物の現状と対策”. 日本獣医師会雑誌 70 : 275-279. NAID 40021212538 .
^ Davies, Gritz; Davies, J (1983), “Plasmid-encoded hygromycin B resistance: the sequence of hygromycin B phosphotransferase gene and its expression in Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae .”, Gene 25 (2-3): 179–88, doi :10.1016/0378-1119(83)90223-8 , PMID 6319235
^ Burgett, Kaster; Burgett, SG; Rao, RN; Ingolia, TD (1983), “Analysis of a bacterial hygromycin B resistance gene by transcriptional and translational fusions and by DNA sequencing.” , Nucleic Acids Res. 11 (19): 6895–911, doi :10.1093/nar/11.19.6895 , PMC 326422 , PMID 6314265 , http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=326422
^ Borovinskaya, Maria A.; Shoji, Shinichiro; Fredrick, Kurt; Cate, Jamie H. D. (2008-8). “Structural basis for hygromycin B inhibition of protein biosynthesis” . RNA (New York, N.Y.) 14 (8): 1590–1599. doi :10.1261/rna.1076908 . ISSN 1469-9001 . PMC 2491480 . PMID 18567815 . https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18567815 .
^ “Genetic and enzymatic basis of hygromycin B resistance in Escherichia coli ” , Antimicrobial Agents and Chemotherapy 24 (5): 689–95, (1983), doi :10.1128/aac.24.5.689 , PMC 185926 , PMID 6318654 , http://aac.asm.org/cgi/content/abstract/24/5/689 .
^ Kauffman, John (2009), “Analytical Strategies for Monitoring Residual Impurities Best methods to monitor product-related impurities throughout the production process.”, BioPharm International 23 : 1–3