大学卒業後の1890年、マサチューセッツ州ボストンのベル電話会社に入社し、研究所に配属された。ベル電話会社では、オリヴァー・ヘヴィサイドの研究を元にした、ニューヨーク=シカゴ間の長距離電話回線の開発に関する数学的分析を行った。その後、電気共振の自動電話交換機への応用の可能性を研究した。1892年、「高周波伝送」(high frequency transmissions)による音声の無線伝送の実験を行った。この実験は失敗したが、この技術は電話回線を使った有線伝送に応用できることがわかり、特許を申請したが、ジョージ・オーウェン・スクワイヤー(英語版)に先んじられた。1893年、有線電話のための電池を加入者側ではなく交換局側に設置して、必要な電流を交換局から供給する「共電式電話(英語版)」を開発した。また、1896年から1906年まで、マサチューセッツ工科大学の物理学と電気工学の大学院生を対象とした電気共振に関する短期講習を行った。
1907年、ストーンは、自社の従業員の養成のために無線電信技術者協会(SWTE: Society of Wireless Telegraph Engineers)を設立し、会長に就任した。この組織は、1912年にニューヨークの無線協会(TWI: The Wireless Institute)と合併して無線学会(IRE: Institute of Radio Engineers)となった。
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