ノカルディア科

ノカルディア科
分類
ドメイン : 真正細菌
Bacteria
門 : 放線菌門
Actinomycetota
綱 : 放線菌綱
Actinomycetes
目 : マイコバクテリウム目
Mycobacteriales
科 : ノカルディア科
Nocardiaceae
学名
Nocardiaceae
Castellani and Chalmers 1919[1]
(IJSEMリストに記載 1980[2])
タイプ属
ノカルディア属
Nocardia
Trevisan 1889[3][4]
(IJSEMリストに記載 1980[2])
下位分類（属）

ノカルディア科（Nocardiaceae）とは放線菌門放線菌綱における科の一つである。偏性好気性、高GC含量、グラム陽性の真性細菌である[5]。一部の種は南極で発見されている[6]。ノカルディア科の細菌は球桿菌状、繊維状、あるいは稀に分解されて柵状の形態を示す[7]。繊維状の種は真菌の菌糸のように枝分かれながら成長する[8]。

遺伝学

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ノカルディア科について、16S rRNAおよびタンパク質の配列解析に基づいた系統樹が両方とも作成されている[9][10]。ノカルディア科のconserved signature indelsとconserved signature proteinsの解析から、同科のNocardia属（ノカルディア属）とRhodococcus属（ロドコッカス属）は非常に近縁であることが明らかとなっている 。2012年現在、16S rRNAと化学分類学的マーカーの解析から、Gordonia属（ゴルドニア属）、Skermania属、Williamsia属、Millisia属、およびSmaragdicoccus属をノカルディア科に転籍させることが提案されている[11]。しかし、ノカルディア属、ロドコッカス属、ゴルドニア属の間で共有されているconserved signature indelsとconserved signature proteinsは発見されていない。

病原性

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ノカルディア科の多くの種は動物に繁殖し、ノカルディア属とロドコッカス属は人間や家畜に感染する恐れがある[12] 。大多数の種はその細胞壁にミコール酸を有しており、抗酸染色で顕微鏡観察すると病原性のマイコバクテリウム属と誤認することがある[13]。

環境への影響

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排水の発泡

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ノカルディア属種は下水処理での活性汚泥に微細な泡を発生させる[14][15][16]。この発泡は下水処理の効率に悪影響を与える。泡の発生を抑える対策として、界面活性剤の投与がある[17][18]。

炭化水素のバイオレメディエーション

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ノカルディア科は、石油成分などに由来する炭化水素を分解する能力を持つ。このため、分解効率と生育能力が高く、環境影響などの問題がない菌株は、石油流出事故などのためのバイオレメディエーションに利用されることが期待されている[19]。

歴史

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かつてノカルディア科にはMicropolyspora属が存在していたが、1980年にその属の種はノカルディア科のNocardia属（ノカルディア属）、Streptosporangiaceae科のNonomuraea属、Pseudonocardiaceae科のSaccharopolyspora属にそれぞれ転籍した[20]。

脚注

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  1. ^ Aldo Castellani, Albert John Chalmers (1919). Manual of tropical medicine, 3rd ed.. doi:10.5962/bhl.title.84653. 
  2. ^ a b V. B. D. Skerman, Vicki. McGOWAN, P. H. A. Sneath (01 January 1980). “Approved Lists of Bacterial Names”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 30 (1). doi:10.1099/00207713-30-1-225. 
  3. ^ Trevisan V (1889). I Generi e le Specie delle Batteriacee. 
  4. ^ ““I Generi e le Specie delle Batteriacee” 1889 with Bibliography of Trevisan's Publications on Systematic Bacteriology”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 2 (1). (01 January 1952). doi:10.1099/0096266X-2-1-11. 
  5. ^ Stackebrandt, Erko, Fred A. Rainey, and Naomi L. Ward-Rainey (1 Apr 1997). “Proposal for a New Hierarchic Classification System, Actinobacteria classis nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 47 (2): 479-491. doi:10.1099/00207713-47-2-479. http://ijs.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/00207713-47-2-479. 
  6. ^ Lyons, W. Berry, Clive Howard-Williams, and Ian Hawes (July, 1996). Ecosystem Processes in Antarctic Ice-free Landscapes: Proceedings of an International Workshop on Polar Desert Ecosystems (1996: Christchurch, NZ). A.A. Balkema 
  7. ^ Scott M Kulich and William A Pasculle. “Final Diagnosis -- Pneumonia, Hilar Lymphadenitis and Sepsis Secondary to Rhodococcus equi”. 2017年8月28日閲覧。
  8. ^ Bitton, Gabriel (2005/05/27). Wastewater Microbiology. 3. John Wiley & Sons 
  9. ^ Ludwig, W.; Euzéby, J.; Schumann, P.; Busse, H. J. R.; Trujillo, M. E.; Kämpfer, P.; Whitman, W. B. (2012). “Road map of the phylum Actinobacteria”. Bergey's Manual® of Systematic Bacteriology. pp. 1. doi:10.1007/978-0-387-68233-4_1. ISBN 978-0-387-95043-3 
  10. ^ Gao, B.; Gupta, R. S. (2012). “Phylogenetic Framework and Molecular Signatures for the Main Clades of the Phylum Actinobacteria”. Microbiology and Molecular Biology Reviews 76 (1): 66–112. doi:10.1128/MMBR.05011-11. PMC 3294427. PMID 22390973. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3294427/. 
  11. ^ Zhi, X. -Y.; Li, W. -J.; Stackebrandt, E. (2009). “An update of the structure and 16S rRNA gene sequence-based definition of higher ranks of the class Actinobacteria, with the proposal of two new suborders and four new families and emended descriptions of the existing higher taxa”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 59 (3): 589–608. doi:10.1099/ijs.0.65780-0. PMID 19244447. 
  12. ^ Castellani, A. and A.J. Chalmers. 1919.
  13. ^ Nocardia: a serious matter for cows.
  14. ^ Blackall, Linda L., Valter Tandoi, and David Jenkins (1991). “Continuous Culture Studies with Nocardia amarae from Activated Sludge and Their Implications for Nocardia Foaming Control”. Research Journal of the Water Pollution Control Federation 63 (1): 44-50. http://www.jstor.org/stable/25043950. 
  15. ^ Pitt, Paul, and David Jenkins (1990). “Causes and control of Nocardia in activated sludge”. Research Journal of the Water Pollution Control Federation 29 (7): 35-42. http://wst.iwaponline.com/content/29/7/35. 
  16. ^ Blackall, Linda L. (1994). “Molecular identification of activated sludge foaming bacteria”. Water Science and Technology 29 (7): 35-42. doi:10.2166/wst.1994.0299. http://wst.iwaponline.com/content/29/7/35. 
  17. ^ Shao, Y. J., Starr, M., Kaporis, K., Kim, H. S., & Jenkins, D. (1997). “Polymer addition as a solution to Nocardia foaming problems”. Water environment research 69 (1): 25-27. doi:10.2175/106143097X125146. http://www.ingentaconnect.com/content/wef/wer/1997/00000069/00000001/art00004. 
  18. ^ Ho, Chu-Fei, and David Jenkins (1991). “The Effect of Surfactants on Nocardia Foaming in Activated Sludge”. Water Science and Technology 23 (4-6): 879-887. http://wst.iwaponline.com/content/23/4-6/879. 
  19. ^ Aislabie, J., McLeod, M., and R. Fraser (Feb 1998). “Potential for biodegradation of hydrocarbons in soil from the Ross Dependency, Antarctica”. Applied Microbiology and Biotechnology 49 (2): 210-214. doi:10.1007/s002530051. https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs002530051160?LI=true. 
  20. ^ Micropolyspora entry in LPSN; Euzéby, J.P. (1997). "List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a folder available on the Internet". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (英語). 47 (2): 590–592. doi:10.1099/00207713-47-2-590. PMID 9103655。