ニューウェル・アムステル(現在のアムステルフェーン)に生まれた。17歳でアムステル大学に入学し、植物学者、ユーゴー・ド・フリースの講義を受けた。ミュンヘン大学のゲーベル(Karl Ritter von Goebel)の研究室で働き、その後チューリッヒ大学のシンツ(Hans Schinz)のもとで研究し、コケ類の再生の研究で博士号を得た。
1906年にスコルテン植物病理学研究所(Willie Commelin Scholten Phytopathological Laboratory)の所長に招かれ、1907年に微生物保存センター(Centraal Bureau voor Schimmelcultures:略称CSB)となる組織の学芸員を務めた。CSBの80あまりだった資料を、6,500の菌類の1万点に達する資料に増やした。1917年にユトレヒト大学の植物病理学の教授に任じられた。1930年にアムステルダム大学の教授も務めた。樹木の寄生虫疾患や植物の生理的疾患の研究を行った。国際大学婦人連盟(International Federation of University Women)の会長を務め、1945年から1951年の間、オランダ植物病理学会の会長を務めた。
Zur Regeneration der Laubmoose. Inaugural-Dissertation zur erlangung der philosophischen Doktorwürde vorgelegt der hohen philosophischen Fakultät, Nijmegen, 1906, dissertatie Zürich
Die Mosaikkrankheit der Tomaten, 1910 (boek)
Untersuchungen über Sclerotinia Libertiana Fuckel als Pflanzenparasit, 1911
De nieuwe wegen van het phytopathologisch onderzoek, 1917, J.H. de Bussy, Amsterdam (boek)
Bijdrage tot de mycologische flora van Nederland, Groningen, De Waal, 1917 (boek)
Relations between horticulture and plantpathology, 1923 (boek)
De groei der phytopathologie, 1930 (boek)
De iepenziekte : Rapport over het onderzoek verricht op verzoek van de Nederlandsche heidemaatschappij, 1933 (boek)
List of cultures 1947, Baarn, 1947 (boek)
Afscheidsrede aan de universiteiten van Utrecht en Amsterdam op 22 November 1952 uitgesproken te Hilversum, 1952
^Kerling, L. C. P.; ten Houten, J. G.; de Bruin-Brink, G.. “Johanna Westerdijk: Pioneer Leader in Plant Pathology”. Annual Review of Phytopathology24 (1): 33–41. doi:10.1146/annurev.py.24.090186.000341.