다음은 균류의 목 목록이다. 모두 155개 목을 포함하고 있다.
| 아계 | 문 | 아문 | 강 | No. | 목 |
|---|---|---|---|---|---|
| 쌍핵균아계 | 자낭균문 | 주발버섯아문 | 아르토니아강 | 1 | 아르토니아목 (Arthoniales) |
| 종기버섯강 | 2 | 둥근버섯목 (Capnodiales) | |||
| 3 | 종기버섯목 (Dothideales) | ||||
| 4 | 흑두병균목 (Myriangiales) | ||||
| 5 | 입술버섯목 (Hysteriales) | ||||
| 6 | Jahnulales | ||||
| 7 | 미틸리니디온목 (Mytilinidiales) | ||||
| 8 | 다포자버섯목 (Pleosporales) | ||||
| 9 | 둥근방버섯목 (Botryosphaeriales) | ||||
| 10 | 작은방패버섯목 (Microthyriales) | ||||
| 11 | 자루컵버섯목 (Patellariales) | ||||
| 12 | Trypetheliales | ||||
| 눈꽃동충하초강 | 13 | 카이토티리움목 (Chaetothyriales) | |||
| 14 | Pyrenulales | ||||
| 15 | Verrucariales | ||||
| 16 | Coryneliales | ||||
| 17 | 진정둥근버섯목 (Eurotiales) | ||||
| 18 | 흰가시동충하초목 (Onygenales) | ||||
| 19 | Mycocaliciales | ||||
| 콩나물버섯강 | 20 | 콩나물버섯목 (Geoglossales) | |||
| 라보울베니아강 | 21 | 라보울베니아목 | |||
| 22 | Pyxidiophorales | ||||
| 요강버섯강 | 23 | 바위딱지지의목 | |||
| 24 | Lecanorales | ||||
| 25 | Peltigerales | ||||
| 26 | Teloschistales | ||||
| 27 | 아기리움목 | ||||
| 28 | 요강버섯목 (Baeomycetales) | ||||
| 29 | 작은입버섯목 | ||||
| 30 | 닭살지의목 | ||||
| 31 | Candelariales | ||||
| 32 | 돌버섯지의목 | ||||
| 두건버섯강 | 33 | Cyttariales | |||
| 34 | Erysiphales | ||||
| 35 | 살갗버섯목 (Helotiales) | ||||
| 36 | 두건버섯목 | ||||
| 37 | 투구버섯목 | ||||
| 38 | Thelebolales | ||||
| 마귀숟갈버섯강 | 39 | 마귀숟갈버섯목 | |||
| 바퀴버섯강 | 40 | 바퀴버섯목 (Orbiliales) | |||
| 주발버섯강 | 41 | 주발버섯목 (Pezizales) | |||
| 동충하초강 | 42 | Coronophorales | |||
| 43 | 동충하초목 (Hypocreales) | ||||
| 44 | Melanosporales | ||||
| 45 | Microascales | ||||
| 46 | Boliniales | ||||
| 47 | Calosphaeriales | ||||
| 48 | 흑단추버섯목 (Chaetosphaeriales) | ||||
| 49 | Coniochaetales | ||||
| 50 | 검뎅이침버섯목 (Diaporthales) | ||||
| 51 | Magnaporthales | ||||
| 52 | Ophiostomatales | ||||
| 53 | 구멍공버섯목 (Sordariales) | ||||
| 54 | 콩꼬투리버섯목 (Xylariales) | ||||
| 55 | Koralionastetales | ||||
| 56 | Lulworthiales | ||||
| 57 | Meliolales | ||||
| 58 | Phyllachorales | ||||
| 59 | Trichosphaeriales | ||||
| 분류 불확실 | 60 | Lahmiales | |||
| 61 | Medeolariales | ||||
| 62 | Triblidiales | ||||
| 사카로미케스아문 | 사카로미케스강 | 63 | 사카로미케스목 (Saccharomycetales) | ||
| 외자낭균아문 | 고생자낭균강 | 64 | 고생자낭균목 | ||
| 네올렉타강 | 65 | 네올렉타목 | |||
| 폐포자충강 | 66 | 폐포자충목 | |||
| 분열효모균강 | 67 | 분열효모균목 | |||
| 외자낭균강 | 68 | 외자낭균목 | |||
| 담자균문 | 녹균아문 | 아가리코스틸붐강 | 69 | 아가리코스틸붐목 | |
| 70 | Spiculostilbales | ||||
| 아트락티엘라강 | 71 | 아트락티엘라목 | |||
| 클라시쿨라강 | 72 | 클라시쿨라목 | |||
| 크립토미코콜락스강 | 73 | 크립토미코콜락스목 | |||
| 키스토바시디움강 | 74 | 키스토바시디움목 | |||
| 75 | Erythrobasidiales | ||||
| 76 | Naohideales | ||||
| 수수깜부기강 | 77 | Heterogastridiales | |||
| 78 | Leucosporidiales | ||||
| 79 | 수수깜부기목 | ||||
| 80 | Sporidiobolales | ||||
| 믹시아강 | 81 | 믹시아목 | |||
| 녹균강 | 82 | 날개무늬병균목 | |||
| 83 | Pachnocybales | ||||
| 84 | Platygloeales | ||||
| 85 | 녹병균목 | ||||
| 86 | 고약병균목 | ||||
| 깜부기균아문 | 엔토르리자강 | 87 | 엔토르리자목 | ||
| 깜부기균강 | 88 | 줄기깜부기균목 | |||
| 89 | 깜부기균목 | ||||
| 떡병균강 | 90 | Doassansiales | |||
| 91 | Entylomatales | ||||
| 92 | 떡병균목 (Exobasidiales) | ||||
| 93 | Georgefischeriales | ||||
| 94 | Microstromatales | ||||
| 95 | Tilletiales | ||||
| 분류 불확실 | 96 | 말라세지아목 (Malasseziales) | |||
| 담자균아문 | 흰목이강 | 97 | Cystofilobasidiales | ||
| 98 | Filobasidiales | ||||
| 99 | 흰목이목 | ||||
| 붉은목이강 | 100 | 붉은목이목 | |||
| 담자균강 | 101 | 주름버섯목 (Agaricales) | |||
| 102 | 부후고약버섯목 (Atheliales) | ||||
| 103 | 그물버섯목 | ||||
| 104 | 방귀버섯목 | ||||
| 105 | 나팔버섯목 | ||||
| 106 | Hysterangiales | ||||
| 107 | 말뚝버섯목 | ||||
| 108 | 목이목 (Auriculariales) | ||||
| 109 | 꾀꼬리버섯목 (Cantharellales) | ||||
| 110 | 고약버섯목 | ||||
| 111 | 조개버섯목 | ||||
| 112 | 소나무비늘버섯목 | ||||
| 113 | 구멍장이버섯목 | ||||
| 114 | 무당버섯목 | ||||
| 115 | 곤약버섯목 | ||||
| 116 | 사마귀버섯목 | ||||
| 117 | 미세고약버섯목 | ||||
| 분류 불확실 | 왈레미아강 | 118 | 왈레미아목 | ||
| 털곰팡이아계 | 취균문 | 취균아문 | 취균강 | 119 | 글로무스목 |
| 120 | 디베르시스포라목 | ||||
| 121 | 파라글로무스목 | ||||
| 122 | 아르카이오스포라목 | ||||
| 털곰팡이문 | 털곰팡이아문 | 엔도고네강 | 123 | 엔도고네목 | |
| 털곰팡이강 | 124 | 털곰팡이목 | |||
| 칼카리스포리엘라문 | 칼카리스포리엘라아문 | 칼카리스포리엘라강 | 125 | 칼카리스포리엘라목 | |
| 모르티에렐라문 | 모르티에렐라아문 | 모르티에렐라강 | 126 | 모르티에렐라목 | |
| 포충균아계 | 키크셀라문 | 키크셀라아문 | 키크셀라강 | 127 | 아셀라리아목 |
| 128 | Barbatosporales | ||||
| 129 | 하르펠라목 | ||||
| 130 | 키크셀라목 | ||||
| 131 | Orphellales | ||||
| 132 | Spiromycetales | ||||
| 디마르가리스강 | 133 | 디마르가리스목 | |||
| 134 | Ramicandelaberales | ||||
| 포충균문 | 포충균아문 | 포충균강 | 135 | 포충균목 | |
| 136 | Zoophagales | ||||
| 곤충곰팡이문 | 곤충곰팡이아문 | 네오지기테스강 | 137 | 네오지기테스목 | |
| 곤충곰팡이강 | 138 | 곤충곰팡이목 | |||
| 올피디움균아계 | 올피디움문 | 올피디움아문 | 올피디움강 | 139 | 올피디움목 |
| 바시디오볼루스균아계 | 바시디오볼루스문 | 바시디오볼루스아문 | 바시디오볼루스강 | 140 | 바시디오볼루스목 |
| 블라스토클라디아균아계 | 블라스토클라디아균문 | 블라스토클라디아균아문 | 블라스토클라디아균강 | 141 | 블라스토클라디아균목 |
| 호상균아계 | 호상균문 | 호상균아문 | 호상균강 | 142 | 호상균목 |
| 143 | 리조피디움목 | ||||
| 144 | 스피젤로미케스목 | ||||
| 모노블레파리스균문 | 모노블레파리스균아문 | 히알로라피디움강 | 145 | 히알로라피디움목 | |
| 모노블레파리스균강 | 146 | 모노블레파리스균목 | |||
| 산키트라움강 | 147 | 산키트라움목 | |||
| 네오칼리마스트릭스균문 | 네오칼리마스트릭스균아문 | 네오칼리마스트릭스균강 | 148 | 네오칼리마스트릭스균목 | |
| 아펠리디움균아계 | 아펠리디움문 | 아펠리디움아문 | 아펠리디움강 | 149 | 아펠리디움목 |
| 로젤라아계 | 로젤라문 (미포자충문) |
로젤라아문 | 로젤라강 | 150 | 로젤라목 |
| Chytridiopsidea | 151 | Chytridiopsida | |||
| 메트크니코벨라강 | 152 | 메트크니코벨라목 | |||
| Microsporidea | 153 | Amblyosporida | |||
| 154 | Neopereziida | ||||
| 155 | Ovavesiculida | ||||
| 156 | Glugeida | ||||
| 157 | Nosematida |
(영어) 균류의 목 목록 - 미국 국립생물공학정보센터