화학유전체학(化學遺傳體學, Chemicogenomics 또는 Chemical genomics)은 대량의 다양한 화학 물질을 이용하여, 대량의 유전자의 발현과 기능을 연구하는 학문이다. 화학유전체학은 유전체학 계열 중에서 신약개발과 가장 가까운 분야이다.
화학유전체학의 주요 분석들은 생정보학 프로그램으로 이루어져 있다.
