Хөрсний микробиологи нь хөрсөн дэх бичил биетэн, тэдгээрийн үйл ажиллагаа, хөрсний шинж чанарт хэрхэн нөлөөлдөгийг судалдаг шинжлэх ухаан юм. Хоёроос дөрвөн тэрбум жилийн өмнө дэлхийн далайд анхны эртний бактери, бичил биетүүд үүссэн гэж үздэг. Эдгээр бактери нь азотыг цаг хугацааны явцад үржүүлж, улмаар агаар мандалд хүчилтөрөгч ялгаруулж чаддаг. Энэ нь хөрсний бүтэц, үржил шимт байдалд нөлөөлдөг тул илүү дэвшилтэт бичил биетүүдийг бий болгосон. Хөрсний бичил биетнийг бактери, актиномицет, мөөгөнцөр, замаг, эгэл биетэн гэж ангилж болно. Эдгээр бүлэг бүр нь тэдгээрийг болон хөрсөн дэх үйл ажиллагааг тодорхойлдог шинж чанартай байдаг.
Үндэслэг мандал гэж нэрлэгддэг ургамлын үндэс болон түүний эргэн тойронд 10 тэрбум хүртэлх бактерийн эсүүд нэг грамм хөрсөнд амьдардаг. 2011 онд баг чихрийн нишингийн үндэс дээр 33,000 гаруй бактери, археал зүйл илрүүлсэн.
Эргэн тойрон дахь орчны өөрчлөлтийн хариуд үндэслэг ишний найрлага хурдан өөрчлөгдөж болно.
Бактери
Вирусаас гадна хөрсөн дэх хамгийн жижиг организм болох бактери ба археа нь прокариот юм. Эдгээр нь хөрсөн дэх хамгийн элбэг бичил биетүүд бөгөөд азотыг бэхлэх зэрэг олон чухал зорилгоор үйлчилдэг.