Magellankorset (Magellan's Cross) er et stort kors oppstilt av portugisiske og spanske oppdagelsesreisende etter ordre fra Ferdinand Magellan da de ankom øya Cebu på Filippinene i 1521.
Korset huses i et lite kapell rett ved Basilica Minore del Santo Niño i Magallanes Street, rett foran rådhuset i Cebu City. Et oppslag forteller at det opprinnelige korset er omgitt av det mye større som er synlig oppstilt midt i kapellet. Dette beskyttelseskorset ble laget for å hindre at pilegrimer og andre besøkende skar av små og store fliser av det indre korset.
Andre mener at det opprinnelige kort gikk tapt etter Magellans død, og at det senere korset tilkom da spanjolene senere i samme århundre lyktes i å kolonisere øygruppen.
Magellankorset er et symbol på Cebu City og kapellet er med på byens segl. Det kan også betraktes som et symbol for filippinsk katolisisme.