Een enterokinase is een enzym dat in de twaalfvingerige darm voorkomt. Het zet trypsinogeen, de inactieve vorm van trypsine, in trypsine om. Trypsine zet vervolgens alle andere pro-enzymen om in de actieve vorm. Expressie-vectoren, gebruikt om bacteriën een gewenste proteïne te laten maken, bevatten vaak een DNA-sequentie die codeert voor een enterokinase. Ondanks de oude naam is het geen kinase.