Barwniki te (33258 i 33342) są wzbudzane światłem ultrafioletowym przy długości faliświetlnej około 345 nm. Maksimum emisji wypada przy około 485 nm (kolor niebiesko-fioletowy)[7]. Ponieważ Hoechst przenika przez nienaruszone błony biologiczne, może być używany do wybarwiania zarówno żywych komórek[8] jak i utrwalonych i często bywa używany jako substytut innego barwnika – DAPI[9]. Różnica pomiędzy nimi, wynika z tego, że Hoechst 33342, wyposażony w dodatkową grupę etylową, jest bardziej lipofilowy, w związku z czym lepiej przenika przez nienaruszone błony biologiczne. Z kolei Hoechst 33258, w niektórych zastosowaniach, ma znacząco mniejszą zdolność penetracji komórek[9].
Barwniki Hoechst nadają się także do ilościowego oznaczania DNA w próbie, gdyż siła ich sygnału jest wprost proporcjonalna do ilości DNA (por. prawo Lamberta-Beera)[10][11].
Ponieważ Hoechst wiążą się bardzo ściśle z DNA na zasadzie interkalacji i tym samym wpływają na jego strukturę, i mogą zaburzać replikację, związki te są toksyczne i mutagenne. Przy pracy z Hoechst powinno się zachować szczególną ostrożność.
↑Comings DE. Mechanisms of chromosome banding. VIII. Hoechst 33258-DNA interaction. „Chromosoma”. 52 (3), s. 229-243, 1976. DOI: 10.1007/BF00332113. PMID: 1183300.
↑Giartosio A., Ferraro A., Lavaggi MV., Allegra P., Turano C. The interaction of bisbenzimide with DNA.. „Physiol Chem Phys Med NMR”. 16 (6), s. 481-490, 1985. PMID: 6085701.
↑Portugal, Jose, Waring, Michael J.. Assignment of DNA binding sites for 4′,6-diamidine-2-phenylindole and bisbenzimide (Hoechst 33258). A comparative footprinting study. „Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression”. 949 (2), s. 158-168, 1988. DOI: 10.1016/0167-4781(88)90079-6.
↑Hoechst Stains. www.biotech.illinois.edu. [dostęp 2015-11-16]. [zarchiwizowane z tego adresu (2015-11-17)].
↑Herzog A., Schütze HR. [Fluorescent staining of mammalian chromosomes with a basically substituted bis-benzimidazole derivative (preparation 33258 "Hoechst")]. „Dtsch Tierarztl Wochenschr”. 75 (19), s. 476-479, 1968. PMID: 4176386. (niem.).
↑Gregoire M., Hernandez-Verdun D., Bouteille M. Visualization of chromatin distribution in living PTO cells by Hoechst 33342 fluorescent staining.. „Exp Cell Res”. 152 (1), s. 38-46, 1984. DOI: 10.1016/0014-4827(84)90228-3. PMID: 6201374.
↑ abOtto F., Tsou KC. A comparative study of DAPI, DIPI, and Hoechst 33258 and 33342 as chromosomal DNA stains. „Stain Technol”. 60 (1), s. 7-11, 1985. DOI: 10.3109/10520298509113885. PMID: 2579484.
↑Downs TR., Wilfinger WW. Fluorometric quantification of DNA in cells and tissue. „Anal Biochem”. 131 (2), s. 538-547, 1983. DOI: 10.1016/0003-2697(83)90212-9. PMID: 6193739.
↑Araki T., Yamamoto A., Yamada M. Accurate determination of DNA content in single cell nuclei stained with Hoechst 33258 fluorochrome at high salt concentration. „Histochemistry”. 87 (4), s. 331-338, 1988. DOI: 10.1007/BF00492587. PMID: 2447036.