Degron

A verde é mostrada uma porção da proteína IκBα, um inibidor da NF-κB e regulador do sistema imunitário. A região a vermelho destaca o sexto domínio de repetição de ankyrin, que contém um degron independente de ubiquitina.[1]

Um degron (do inglês degron) é uma porção de uma proteína que é importante na regulação das taxas de degradação proteica. Entre os degrons conhecidos encontram-se sequências curtas de aminoácidoss,[2] motivos estruturais[1] e aminoácidos expostos (geralmente lisina[3] ou arginina[4]) localizado noutras partes da proteína. De facto, algumas proteínas podem até conter vários degrons.[1][5] Os degrons estão presentes em vários organismos, desde os N-degrons (ver regra do N-terminal) que foram caracterizadas pela primeira vez em leveduras[6] à sequência PEST da ornitina descarboxilase do rato.[7] Os degrons foram identificados tanto em procariotas[8] como em eucariotas. Embora existam muitos tipos de degrons e um elevado grau de variabilidade mesmo dentro destes grupos, os degrons são todos semelhantes no seu papel na regulação da taxa de degradação de uma proteína.[9][10][11] Tal como acontece com a degradação proteica (ver proteólise), os mecanismos são classificados pela sua dependência ou não da ubiquitina, uma pequena proteína envolvida na degradação proteica no proteossoma.[12][13][14] Os degrons podem também ser referidos como "dependentes da ubiquitina"[9] ou "independentes da ubiquitina".[10][11]

Tipos

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Os degrons dependentes de ubiquitina são assim designados porque estão envolvidos no processo de poliubiquitinação para marcar uma proteína para degradação no proteossoma.[15][16] Em alguns casos, o próprio degron serve de local para a poliubiquitinação, como nas proteínas TAZ e β-catenina.[17] Como o mecanismo exato pelo qual um degron está envolvido na poliubiquitinação da proteína, os degrons são classificados como dependentes de ubiquitina se a sua remoção da proteína provocar uma menor ubiquitinação ou se a sua adição a outra proteína provocar uma maior ubiquitinação.[18][19]

Em contraponto, os degrons dependentes de ubiquitina não são necessariamente para a poliubiquitinação da sua proteína. Por exemplo, o degron encontrado na proteína IκBα, uma proteína que atua na regulação do sistema imunitário, não está envolvido na ubiquitinação, uma vez que a sua adição à proteína fluorescente verde (GFP) não aumenta a ubiquitinação.[1] No entanto, um degron por si só pode fornecer uma pista sobre o mecanismo pelo qual uma proteína é degradada[20] e, por isso, identificar e classificar um degron é apenas o primeiro passo para compreender o processo de degradação desta proteína.

Referências

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  2. ↑ Cho, Sungchan; Dreyfuss, Gideon (1 de março de 2010). «A degron created by SMN2 exon 7 skipping is a principal contributor to spinal muscular atrophy severity». Genes & Development. 24 (5): 438–442. ISSN 1549-5477. PMC 2827839Acessível livremente. PMID 20194437. doi:10.1101/gad.1884910 
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  4. ↑ Varshavsky, A. (29 de outubro de 1996). «The N-end rule: functions, mysteries, uses». Proceedings of the National Academy of Sciences (em inglês). 93 (22): 12142–12149. Bibcode:1996PNAS...9312142V. ISSN 0027-8424. PMC 37957Acessível livremente. PMID 8901547. doi:10.1073/pnas.93.22.12142 
  5. ↑ Kanarek, Naama; London, Nir; Schueler-Furman, Ora; Ben-Neriah, Yinon (1 de fevereiro de 2010). «Ubiquitination and degradation of the inhibitors of NF-kappaB». Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 2 (2): a000166. ISSN 1943-0264. PMC 2828279Acessível livremente. PMID 20182612. doi:10.1101/cshperspect.a000166 
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