O Prêmio Francqui é um prêmio de ciências da Bélgica, concedido anualmente desde 1933 pela Fundação Francqui, em reconhecimento às conquistas de pesquisadores belgas com idade inferior a 50 anos. Homenageia Emile Francqui.
É dotado com € 150.000, concedido em um ciclo de três anos às áreas de ciências exatas, ciências sociais e ciências biológicas ou médicas.