TCF4

TCF4
Estruturas disponíveis PDB Pesquisa Human UniProt: PDBe RCSB Lista de códigos id do PDB 2KWF
Identificadores
Nomes alternativos	TCF4
IDs externos	OMIM: 602272 HomoloGene: 2407 GeneCards: TCF4
Doenças Geneticamente Relacionadas
morbid obesity, esquizofrenia, colite ulcerosa, sclerosing cholangitis, Distrofia de Fuchs, Pitt-Hopkins syndrome, Distrofia de Fuchs[1]
Ontologia genética Função molecular • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • bHLH transcription factor binding • E-box binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 ligação a proteínas plasmáticas • identical protein binding • TFIIB-class transcription factor binding • protein heterodimerization activity • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Componente celular • transcription regulator complex • núcleo celular • beta-catenin-TCF complex • beta-catenin-TCF7L2 complex Processo biológico • diferenciação celular • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • protein-DNA complex assembly • transcription, DNA-templated • nervous system development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • DNA-templated transcription, initiation • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of neuron differentiation Sources:Amigo / QuickGO
Ortólogos Espécie Humano Rato Entrez 6925 n/a Ensembl ENSG00000196628 n/a UniProt P15884 n/a RefSeq (mRNA) NM_001083962 NM_001243226 NM_001243227 NM_001243228 NM_001243230 NM_001243231 NM_001243232 NM_001243233 NM_001243234 NM_001243235 NM_001243236 NM_001306207 NM_001306208 NM_003199 NM_001330604 NM_001330605 NM_001348211 NM_001348212 NM_001348213 NM_001348214 NM_001348215 NM_001348216 NM_001348217 NM_001348218 NM_001348219 NM_001348220 NM_001369572 NM_001369573 NM_001369574 NM_001369575 NM_001369576 NM_001369577 NM_001369578 NM_001369579 NM_001369580 NM_001369581 NM_001369582 NM_001369583 NM_001369584 NM_001369585 NM_001369586 NM_001369567 NM_001369568 NM_001369569 NM_001369570 NM_001369571 n/a RefSeq (proteína) NP_001077431 NP_001230155 NP_001230156 NP_001230157 NP_001230159 NP_001230160 NP_001230161 NP_001230162 NP_001230163 NP_001230164 NP_001230165 NP_001293136 NP_001293137 NP_001317533 NP_001317534 NP_003190 NP_001335140 NP_001335141 NP_001335142 NP_001335143 NP_001335144 NP_001335145 NP_001335146 NP_001335147 NP_001335148 NP_001335149 NP_001356501 NP_001356502 NP_001356503 NP_001356504 NP_001356505 NP_001356506 NP_001356507 NP_001356508 NP_001356509 NP_001356510 NP_001356511 NP_001356512 NP_001356513 NP_001356514 NP_001356515 NP_001356496 NP_001356497 NP_001356498 NP_001356499 NP_001356500 n/a Localização (UCSC) n/a n/a Pesquisa PubMed [2] n/a
Wikidata
Ver/Editar Humano

Fator de transcrição 4 (TCF-4) também conhecido como fator de transcrição de imunoglobulina 2 (ITF-2) é uma proteína que em humanos é codificada pelo gene TCF4 localizado no cromossomo 18q21.2.^[3]

Funções

As proteínas TCF4 atuam como fatores de transcrição que se ligam ao motivo mu-E5 / kappa-E2, que aumenta a imunoglobulina. TCF4 ativa a transcrição ligando-se à sequência E-box (5’-CANNTG-3 ’) encontrada geralmente no elemento iniciador do SSTR2-INR ou receptor 2 da somatostatina. Posteriormente, ele será encontrado na tireóide, no timo e nos rins, enquanto na idade adulta o TCF4 é encontrado nos linfócitos, músculos e sistema gastrointestinal.^[4][5]

Importância clínica

Mutações no TCF4 causam a síndrome de Pitt-Hopkins (PTHS). Essas mutações fazem com que as proteínas TCF4 não se liguem ao DNA adequadamente e controlem a diferenciação do sistema nervoso. Na maioria dos casos estudados, as mutações foram de novo, o que significa que foi uma nova mutação não encontrada em outros membros da família do paciente. Os sintomas comuns da síndrome de Pitt-Hopkins incluem boca larga, problemas gastrointestinais, atraso no desenvolvimento de habilidades motoras finas, problemas de fala e respiração, epilepsia e outros defeitos cerebrais.^[6][7]

Um estudo identificou o gene TCF4 como um regulador principal da esquizofrenia.^[8]

Referências

1. «Doenças geneticamente associadas a TCF4 ver/editar referências no wikidata» 
2. «Human PubMed Reference:» 
3. Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (fevereiro de 1990). «Sequence of the cDNA encoding ITF-2, a positive-acting transcription factor». Nucleic Acids Research. 18 (3). 678 páginas. PMC 333500. PMID 2308860. doi:10.1093/nar/18.3.678 
4. de Pontual L, Mathieu Y, Golzio C, Rio M, Malan V, Boddaert N, et al. (abril de 2009). «Mutational, functional, and expression studies of the TCF4 gene in Pitt-Hopkins syndrome». Human Mutation. 30 (4): 669–76. PMID 19235238. doi:10.1002/humu.20935 
5. Pscherer A, Dörflinger U, Kirfel J, Gawlas K, Rüschoff J, Buettner R, Schüle R (dezembro de 1996). «The helix-loop-helix transcription factor SEF-2 regulates the activity of a novel initiator element in the promoter of the human somatostatin receptor II gene». The EMBO Journal. 15 (23): 6680–90. PMC 452492. PMID 8978694 
6. Amiel J, Rio M, de Pontual L, Redon R, Malan V, Boddaert N, et al. (maio de 2007). «Mutations in TCF4, encoding a class I basic helix-loop-helix transcription factor, are responsible for Pitt-Hopkins syndrome, a severe epileptic encephalopathy associated with autonomic dysfunction». American Journal of Human Genetics. 80 (5): 988–93. PMC 1852736. PMID 17436254. doi:10.1086/515582 
7. Zweier C, Peippo MM, Hoyer J, Sousa S, Bottani A, Clayton-Smith J, et al. (maio de 2007). «Haploinsufficiency of TCF4 causes syndromal mental retardation with intermittent hyperventilation (Pitt-Hopkins syndrome)». American Journal of Human Genetics. 80 (5): 994–1001. PMC 1852727. PMID 17436255. doi:10.1086/515583 
8. «Scientists recognize genes as master regulators in schizophrenia». Tech Explorist (em inglês). 16 de setembro de 2019. Consultado em 16 de setembro de 2019 

Leitura adicional

• Herbst A, Helferich S, Behrens A, Göke B, Kolligs FT (outubro de 2009). «The transcription factor ITF-2A induces cell cycle arrest via p21(Cip1)». Biochemical and Biophysical Research Communications. 387 (4): 736–40. PMID 19635457. doi:10.1016/j.bbrc.2009.07.102 
• Cisse B, Caton ML, Lehner M, Maeda T, Scheu S, Locksley R, Holmberg D, Zweier C, den Hollander NS, Kant SG, Holter W, Rauch A, Zhuang Y, Reizis B (outubro de 2008). «Transcription factor E2-2 is an essential and specific regulator of plasmacytoid dendritic cell development». Cell. 135 (1): 37–48. PMC 2631034. PMID 18854153. doi:10.1016/j.cell.2008.09.016 
• Bain G, Murre C (abril de 1998). «The role of E-proteins in B- and T-lymphocyte development». Seminars in Immunology. 10 (2): 143–53. PMID 9618760. doi:10.1006/smim.1998.0116 
• Yerges LM, Klei L, Cauley JA, Roeder K, Kammerer CM, Moffett SP, et al. (dezembro de 2009). «High-density association study of 383 candidate genes for volumetric BMD at the femoral neck and lumbar spine among older men». Journal of Bone and Mineral Research. 24 (12): 2039–49. PMC 2791518. PMID 19453261. doi:10.1359/jbmr.090524 
• Purcell SM, Wray NR, Stone JL, Visscher PM, O'Donovan MC, Sullivan PF, Sklar P (agosto de 2009). «Common polygenic variation contributes to risk of schizophrenia and bipolar disorder». Nature. 460 (7256): 748–52. PMC 3912837. PMID 19571811. doi:10.1038/nature08185 
• Kalscheuer VM, Feenstra I, Van Ravenswaaij-Arts CM, Smeets DF, Menzel C, Ullmann R, Musante L, Ropers HH (agosto de 2008). «Disruption of the TCF4 gene in a girl with mental retardation but without the classical Pitt-Hopkins syndrome». American Journal of Medical Genetics Part A. 146A (16): 2053–9. PMID 18627065. doi:10.1002/ajmg.a.32419 
• Herbst A, Bommer GT, Kriegl L, Jung A, Behrens A, Csanadi E, et al. (agosto de 2009). «ITF-2 is disrupted via allelic loss of chromosome 18q21, and ITF-2B expression is lost at the adenoma-carcinoma transition». Gastroenterology. 137 (2): 639–48, 648.e1-9. PMID 19394332. doi:10.1053/j.gastro.2009.04.049 
• Nagasawa M, Schmidlin H, Hazekamp MG, Schotte R, Blom B (setembro de 2008). «Development of human plasmacytoid dendritic cells depends on the combined action of the basic helix-loop-helix factor E2-2 and the Ets factor Spi-B». European Journal of Immunology. 38 (9): 2389–400. PMID 18792017. doi:10.1002/eji.200838470 
• Rosenfeld JA, Leppig K, Ballif BC, Thiese H, Erdie-Lalena C, Bawle E, Sastry S, Spence JE, Bandholz A, Surti U, Zonana J, Keller K, Meschino W, Bejjani BA, Torchia BS, Shaffer LG (novembro de 2009). «Genotype-phenotype analysis of TCF4 mutations causing Pitt-Hopkins syndrome shows increased seizure activity with missense mutations». Genetics in Medicine. 11 (11): 797–805. PMID 19938247. doi:10.1097/GIM.0b013e3181bd38a9 
• Stefansson H, Ophoff RA, Steinberg S, Andreassen OA, Cichon S, Rujescu D, et al. (agosto de 2009). «Common variants conferring risk of schizophrenia». Nature. 460 (7256): 744–7. PMC 3077530. PMID 19571808. doi:10.1038/nature08186 

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