KRAS

KRAS
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 4WA7, 1D8D, 1D8E, 3GFT, 4DSN, 4DSO, 4EPR, 4EPT, 4EPV, 4EPW, 4EPX, 4EPY, 4L8G, 4LDJ, 4LPK, 4LRW, 4LUC, 4LV6, 4LYF, 4LYH, 4LYJ, 4M1O, 4M1S, 4M1T, 4M1W, 4M1Y, 4M21, 4M22, 4NMM, 4OBE, 4PZY, 4PZZ, 4Q01, 4Q02, 4Q03, 4QL3, 4TQ9, 4TQA, 4DST, 4DSU, 5F2E,%%s2MSC, 2MSD, 2MSE
Идентификаторы
Псевдонимы	KRAS, C-K-RAS, CFC2, K-RAS2A, K-RAS2B, K-RAS4A, K-RAS4B, KI-RAS, KRAS1, KRAS2, NS, NS3, RALD, RASK2, K-ras, KRAS proto-oncogene, GTPase, c-Ki-ras2, OES, c-Ki-ras, K-Ras 2, 'C-K-RAS, K-Ras, Kirsten RAt Sarcoma virus, Kirsten Rat Sarcoma virus
Внешние ID	OMIM: 190070 MGI: 96680 HomoloGene: 37990 GeneCards: KRAS
Расположение гена (человек) Хр. 12-я хромосома человека[1] Локус 12p12.1 Начало 25,205,246 bp[1] Конец 25,250,936 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 6-я хромосома мыши[2] Локус 6 G3|6 77.37 cM Начало 145,162,425 bp[2] Конец 145,195,965 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в trigeminal ganglion mucosa of sigmoid colon mucosa of pharynx tail of epididymis Наибольшая экспрессия в left colon medullary collecting duct conjunctival fornix cumulus cell endothelial cell of lymphatic vessel left lung lobe medial ganglionic eminence Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция нуклеотид-связывающий LRR domain binding GDP binding protein-containing complex binding GTP binding GMP binding связывание с белками плазмы GTPase activity связывание похожих белков Компонент клетки цитоплазма цитозоль мембрана фокальные контакты extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane клеточная мембрана митохондрия липидный рафт Биологический процесс визуальное обучение negative regulation of neuron apoptotic process response to mineralocorticoid positive regulation of protein phosphorylation regulation of long-term neuronal synaptic plasticity regulation of protein stability epidermal growth factor receptor signaling pathway positive regulation of MAP kinase activity cytokine-mediated signaling pathway negative regulation of cell differentiation stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway response to glucocorticoid MAPK cascade Аксональное наведение Fc-epsilon receptor signaling pathway positive regulation of nitric-oxide synthase activity forebrain astrocyte development endocrine signaling positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity homeostasis of number of cells within a tissue striated muscle cell differentiation Ras protein signal transduction epithelial tube branching involved in lung morphogenesis regulation of synaptic transmission, GABAergic actin cytoskeleton organization leukocyte migration передача сигнала positive regulation of Rac protein signal transduction positive regulation of gene expression позитивная регуляция пролиферации клеток ERBB2 signaling pathway развитие печени positive regulation of cellular senescence женская беременность response to isolation stress Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 3845 16653 Ensembl ENSG00000133703 ENSMUSG00000030265 UniProt P01116 P32883 RefSeq (мРНК) NM_004985 NM_033360 NM_001369786 NM_001369787 NM_021284 RefSeq (белок) NP_004976 NP_203524 NP_001356715 NP_001356716 NP_004976.2 NP_067259 NP_001390169 NP_001390170 NP_001390171 NP_001390172 NP_001390173 NP_001390174 NP_001390175 Локус (UCSC) Chr 12: 25.21 – 25.25 Mb Chr 6: 145.16 – 145.2 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

KRAS — протоонкоген, представитель семейства белков Ras. Белок KRAS представляет собой ГТФазу и является компонентом многих путей передачи сигнала. KRAS имеет изопрениловую группу на С-конце и обычно связан с клеточными мембранами.

KRAS действует как «молекулярный переключатель», после включения он активирует белки, необходимые для распространения факторов роста и других путей, таких, как c-Raf и PI 3-kinase. KRAS связывает GTP в активном состоянии и может превращать его в GDP. После превращения GTP в GDP, белок KRAS «выключается». Скорость превращения обычно низкая, но может значительно повышаться при действии вспомогательных белков, усиливающих ГТФазную активность, например, RasGAP. KRAS в свою очередь может связываться с белками GEF, например, SOS1, которые облегчают освобождение связанных нуклеотидов. Соответственно, KRAS без нуклеотида легко связывает новые молекулы GTP или GDP из цитозоля. Ввиду того, что концентрация GTP в цитозоле значительно выше, чем GDP, это обычно приводит к активации KRAS.

Другие представители семейства белков Ras: HRAS, RRAS и NRAS. Эти белки подвергаются регуляции подобным образом, но работают в разных местах клетки.

Заболевания

Некоторые мутации KRAS в клетках зародышевого пути связаны с синдромом Нунан^[5] и синдромом сердце-лицо-кожа (en:cardio-facio-cutaneous syndrome).^[6]

Соматические мутации гена KRAS часто обнаруживают при лейкемиях, раке толстой кишки,^[7] раке поджелудочной железы^[8] и раке легких.^[9] Определение мутационного статуса гена KRAS имеет значение при планировании терапии препаратами блокаторами EGFR, такими как цетуксимаб, в случае рака толстой кишки.^[10] Мутация в гене KRAS обуславливает лиганд-независимую активацию пути передачи сигнала Ras/MAPK. Таким образом, карциномы с мутантным KRAS резистентны ^[11] к терапии анти-EGFR моноклональными антителами (панитумумаб, цетуксимаб, где «маб» — означает моноклональное антитело) и ингибиторами EGFR-TK (en:erlotinib, en:gefitinib).

Исследование KRAS

Анализ мутаций KRAS делают некоторые лаборатории на коммерческой основе.

Примечания

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000133703 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030265 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Schubbert S., Zenker M., Rowe S. L., et al. Germline KRAS mutations cause Noonan syndrome (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2006. — Vol. 38, no. 3. — P. 331—336. — doi:10.1038/ng1748. — PMID 16474405.
6. Niihori T., Aoki Y., Narumi Y., et al. Germline KRAS and BRAF mutations in cardio-facio-cutaneous syndrome (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2006. — Vol. 38, no. 3. — P. 294—296. — doi:10.1038/ng1749. — PMID 16474404.
7. Burmer G. C., Loeb L. A. Mutations in the KRAS2 oncogene during progressive stages of human colon carcinoma (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1989. — Vol. 86, no. 7. — P. 2403—2407. — doi:10.1073/pnas.86.7.2403. — PMID 2648401.
8. Almoguera C., Shibata D., Forrester K., Martin J., Arnheim N., Perucho M. Most human carcinomas of the exocrine pancreas contain mutant c-K-ras genes (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1988. — Vol. 53, no. 4. — P. 549—554. — doi:10.1016/0092-8674(88)90571-5. — PMID 2453289.
9. Tam I. Y., Chung L. P., Suen W. S., et al. Distinct epidermal growth factor receptor and KRAS mutation patterns in non-small cell lung cancer patients with different tobacco exposure and clinicopathologic features (англ.) // Clin. Cancer Res.^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 12, no. 5. — P. 1647—1653. — doi:10.1158/1078-0432.CCR-05-1981. — PMID 16533793.
10. Lièvre A., Bachet J. B., Le Corre D., et al. KRAS mutation status is predictive of response to cetuximab therapy in colorectal cancer (англ.) // Cancer Research^[англ.] : journal. — American Association for Cancer Research^[англ.], 2006. — Vol. 66, no. 8. — P. 3992—3995. — doi:10.1158/0008-5472.CAN-06-0191. — PMID 16618717.
11. EGF receptor  (неопр.). Дата обращения: 5 ноября 2007. Архивировано 25 марта 2012 года.

Литература

• Kahn S., Yamamoto F., Almoguera C., et al. The c-K-ras gene and human cancer (review). (англ.) // Anticancer Res.^[англ.] : journal. — 1987. — Vol. 7, no. 4A. — P. 639—652. — PMID 3310850.
• Yamamoto F., Nakano H., Neville C., Perucho M. Structure and mechanisms of activation of c-K-ras oncogenes in human lung cancer. (англ.) // Prog. Med. Virol. : journal. — 1985. — Vol. 32. — P. 101—114. — PMID 3895297.
• Porta M., Ayude D., Alguacil J., Jariod M. Exploring environmental causes of altered ras effects: fragmentation plus integration? (англ.) // Mol. Carcinog. : journal. — 2003. — Vol. 36, no. 2. — P. 45—52. — doi:10.1002/mc.10093. — PMID 12557259.
• Smakman N., Borel Rinkes I. H., Voest E. E., Kranenburg O. Control of colorectal metastasis formation by K-Ras. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 1756, no. 2. — P. 103—114. — doi:10.1016/j.bbcan.2005.07.001. — PMID 16098678.
• Castagnola P., Giaretti W. Mutant KRAS, chromosomal instability and prognosis in colorectal cancer. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 1756, no. 2. — P. 115—125. — doi:10.1016/j.bbcan.2005.06.003. — PMID 16112461.
• Deramaudt T., Rustgi A. K. Mutant KRAS in the initiation of pancreatic cancer. (англ.) // Biochim. Biophys. Acta^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 1756, no. 2. — P. 97—101. — doi:10.1016/j.bbcan.2005.08.003. — PMID 16169155.
• Pretlow T. P., Pretlow T. G. Mutant KRAS in aberrant crypt foci (ACF): initiation of colorectal cancer? (англ.) // Biochim. Biophys. Acta^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 1756, no. 2. — P. 83—96. — doi:10.1016/j.bbcan.2005.06.002. — PMID 16219426.
• Su Y. H., Wang M., Aiamkitsumrit B., et al. Detection of a K-ras mutation in urine of patients with colorectal cancer. (англ.) // Cancer biomarkers : section a of Disease markers : journal. — 2007. — Vol. 1, no. 2—3. — P. 177—182. — PMID 17192038.