PROX1

PROX1
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 2LMD
Идентификаторы
Псевдонимы	PROX1, prospero homeobox 1
Внешние ID	OMIM: 601546 MGI: 97772 HomoloGene: 2069 GeneCards: PROX1
Расположение гена (человек) Хр. 1-я хромосома человека[1] Локус 1q32.3 Начало 213,983,181 bp[1] Конец 214,041,510 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 1-я хромосома мыши[2] Локус 1 H6|1 95.85 cM Начало 189,850,232 bp[2] Конец 189,902,911 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в sural nerve right lobe of liver buccal mucosa cell Skeletal muscle tissue of biceps brachii body of pancreas Наибольшая экспрессия в neural layer of retina dentate gyrus of hippocampal formation granule cell nucleus reuniens lumbar subsegment of spinal cord Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция ДНК-связывающий sequence-specific DNA binding transcription corepressor activity DNA binding domain binding DNA-binding transcription factor activity LBD domain binding DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific core promoter sequence-specific DNA binding связывание с белками плазмы nuclear receptor binding transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Компонент клетки цитоплазма клеточное ядро Биологический процесс dorsal spinal cord development olfactory placode formation ДНК-зависимая регуляция транскрипции positive regulation of endothelial cell proliferation venous blood vessel morphogenesis нефрогенез lymphangiogenesis развитие лёгких развитие зубчатой извилины ритмический процесс ventricular septum morphogenesis cardiac muscle cell differentiation lymphatic endothelial cell differentiation positive regulation of sarcomere organization positive regulation of forebrain neuron differentiation endocardium formation hepatocyte differentiation negative regulation of transcription by RNA polymerase II negative regulation of DNA-binding transcription factor activity lymph vessel development hepatocyte cell migration транскрипция, ДНК-зависимая lens placode formation involved in camera-type eye formation skeletal muscle thin filament assembly neuronal stem cell population maintenance positive regulation of endothelial cell migration ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции positive regulation of heart growth ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis positive regulation of neural precursor cell proliferation retina morphogenesis in camera-type eye развитие многоклеточного организма negative regulation of viral genome replication развитие мозга branching involved in pancreas morphogenesis positive regulation of cell cycle lens development in camera-type eye response to nutrient levels hepatocyte proliferation positive regulation of cell cycle checkpoint regulation of circadian rhythm циркадный ритм acinar cell differentiation развитие нервной трубки neuron differentiation позитивная регуляция пролиферации клеток lens morphogenesis in camera-type eye positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity negative regulation of bile acid biosynthetic process embryonic retina morphogenesis in camera-type eye Регуляция экспрессии генов ייעוד התא развитие поджелудочной железы развитие печени atrial cardiac muscle tissue morphogenesis endothelial cell differentiation inner ear development negative regulation of transcription, DNA-templated ventricular cardiac myofibril assembly otic placode formation aorta smooth muscle tissue morphogenesis cerebellar granule cell differentiation негативная регуляция пролиферации клеток положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор lens fiber cell morphogenesis Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 5629 19130 Ensembl ENSG00000117707 ENSMUSG00000010175 UniProt Q92786 P48437 RefSeq (мРНК) NM_001270616 NM_002763 NM_008937 NM_001360827 RefSeq (белок) NP_001257545 NP_002754 NP_032963 NP_001347756 Локус (UCSC) Chr 1: 213.98 – 214.04 Mb Chr 1: 189.85 – 189.9 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

PROX1 (англ. Prospero homeobox protein 1) — белок, являющийся гомеобоксным транскрипционным фактором, который участвует в развитии лимфатической системы и сетчатки глаза^[5][6].

Белок PROX1 экспрессируется в поверхностных лимфатических сосудах вместе с рецепторами фактора роста эндотелия VEGF. Направляет в митохондрии фермент CPT1A, который ускоряет окислительную обработку жирных кислот для ускоренного строительства новых лимфатических сосудов. Одновременно CPT1A увеличивает продукцию ацетилкофермента А в зависимости от объёма β-окисления жирных кислот. Ацетилкофермент А с помощью ацилирования модифицирует гистоны в лимфангиогенных генах для возможности cчитывания^[7][8].

Примечания

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000117707 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000010175 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Elsir T. et al. Transcription factor PROX1: its role in development and cancer (англ.) // Cancer and metastasis reviews. — 2012. — Vol. 31, no. 3—4. — P. 793—805. — doi:10.1007/s10555-012-9390-8. Архивировано 20 января 2022 года.
6. Dyer M. A. et al. Prox1 function controls progenitor cell proliferation and horizontal cell genesis in the mammalian retina (англ.) // Nature genetics. — 2003. — Vol. 34, no. 1. — P. 53—58. — doi:10.1038/ng1144. Архивировано 21 января 2022 года.
7. Tumor Angiogenesis: Basic Mechanisms and Cancer Therapy (англ.) / Dieter Marmé, Norbert Fusenig. — Berlin: Springer, 2007. — ISBN 978-3-540-33176.
8. Wong B. W. et al. The role of fatty acid β-oxidation in lymphangiogenesis (англ.) // Nature. — 2017. — Vol. 542, no. 7639. — P. 49—54. — doi:10.1038/nature21028. Архивировано 20 октября 2021 года.

Видеоматериалы

•  Видеоролик с описанием работы PROX1 при росте лимфатического сосуда.