SAP30

Белок, ассоциированный с Sin3A, 30kDa
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

2KDP

Идентификаторы
Символ SAP30
Внешние ID OMIM: 603378 MGI: 1929129 HomoloGene: 2869 GeneCards: Ген SAP30
Генная онтология
Функция • DNA binding

• transcription corepressor activity
• protein binding

• metal ion binding
Компонент клетки • histone deacetylase complex
Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

• transcription, DNA-templated
• regulation of transcription, DNA-templated

• skeletal muscle cell differentiation
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 8819 60406
Ensembl ENSG00000164105 ENSMUSG00000031609
UniProt O75446 O88574
RefSeq (мРНК) NM_003864 NM_021788
RefSeq (белок) NP_003855 NP_068560
Локус (UCSC) Chr 4:
174.29 – 174.3 Mb		 Chr 8:
57.48 – 57.49 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Белок, ассоциированный с Sin3A, 30 кДа, известный также как SAP30, — белок, кодируемый у человека геном SAP30[1].

Функция

[править | править код]

Ацетилирование гистонов играет ключевую роль в регуляции экспрессии эукариотических генов. Ацетилирование и деацетилирование гистонов катализируют мультисубъединичные комплексы. Белок, кодируемый этим геном — составляющая комплекса гистондеацетилазы, который включает в себя SIN3A, SAP18, HDAC1, HDAC2, RbAp46, RbAp48 и другие полипептиды. Этот комплекс принимает активное участие в деацетилировании основных гистонов октамеров, но бездействует при деацетилировании нуклеосомных гистонов. Псевдоген этого гена находится на хромосоме 3[1].

Млекопитающие имеют один паралог SAP30, названный SAP30-подобным (SAP30L), доступные последовательности которого на 70 % идентичны с SAP30[2]. SAP30 и SAP30L вместе составляют хорошо сохранившееся семейство белков SAP30. SAP30L также взаимодействует с несколькими компонентами корепрессора комплекса Sin3A и вызывает репрессию транскрипции с помощью рекрутирования Sin3A и гистондеацетилаз[3].

Белки семейства SAP30 имеют функциональную ядерную локализацию сигнала и они могут передавать сигнал Sin3A к ядру[3]. Белки SAP30 имеют независимый контакт последовательностей с ДНК, их N-терминальнвй цинкозависимой модуль и их кислый центральный регион вносит свой вклад в взаимодействия гистонов и нуклеосом. ДНК-связывание белков SAP30 регулируется ядерной сигнализацией липидов, фосфоинозитидов (PI)[4]. Белки SAP30 предоставляют первый пример, в котором ДНК и PI, кажется, стоят во взаимно антагонистических взаимоотношениях в части их взаимодействия с белками цинкового пальца и, таким образом, иллюстрируют молекулярный механизм, как эти липиды могут способствовать регуляции генов[4][5].

Взаимодействия

[править | править код]

SAP30, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1[6][7][8][9][10][11], гистондеацетилазой 2[7][8][11], SIN3A[7][8][10][11][12][13], RBBP7[7][8][11], корепрессором ядерных рецепторов 1[13][14], RBBP4[7][8][11], ING1[11] и YY1[6].

Примечания

[править | править код]
  1. ↑ 1 2 Entrez Gene: SAP30 Sin3A-associated protein, 30kDa.
  2. ↑ Lindfors K., Viiri K.M., Niittynen M., Heinonen T.Y., Mäki M., Kainulainen H. TGF-beta induces the expression of SAP30L, a novel nuclear protein (англ.) // BMC Genomics[англ.] : journal. — 2003. — December (vol. 4). — P. 53. — doi:10.1186/1471-2164-4-53. — PMID 14680513. — PMC 319701.
  3. ↑ 1 2 Viiri K.M., Korkeamäki H., Kukkonen M.K., Nieminen L.K., Lindfors K., Peterson P., Mäki M., Kainulainen H., Lohi O. SAP30L interacts with members of the Sin3A corepressor complex and targets Sin3A to the nucleolus (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2006. — Vol. 34, no. 11. — P. 3288—3298. — doi:10.1093/nar/gkl401. — PMID 16820529. — PMC 1500868.
  4. ↑ 1 2 Viiri K.M., Jänis J., Siggers T., Heinonen T.Y., Valjakka J., Bulyk M.L., Mäki M., Lohi O. DNA-binding and -bending activities of SAP30L and SAP30 are mediated by a zinc-dependent module and monophosphoinositides (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2009. — January (vol. 29, no. 2). — P. 342—356. — doi:10.1128/MCB.01213-08. — PMID 19015240. — PMC 2612513.
  5. ↑ TamPub. Дата обращения: 20 апреля 2015. Архивировано из оригинала 25 мая 2011 года.
  6. ↑ 1 2 Huang, Nu En; Lin Ching Hui; Lin Young Sun; Yu Winston C Y. Modulation of YY1 activity by SAP30 (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications[англ.] : journal. — United States, 2003. — June (vol. 306, no. 1). — P. 267—275. — ISSN 0006-291X. — doi:10.1016/S0006-291X(03)00966-5. — PMID 12788099.
  7. ↑ 1 2 3 4 5 Zhang, Y; Sun Z W; Iratni R; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Hampsey M; Reinberg D. SAP30, a novel protein conserved between human and yeast, is a component of a histone deacetylase complex (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — UNITED STATES, 1998. — June (vol. 1, no. 7). — P. 1021—1031. — ISSN 1097-2765. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80102-1. — PMID 9651585.
  8. ↑ 1 2 3 4 5 Zhang, Y; Ng H H; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Bird A; Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes & Development : journal. — UNITED STATES, 1999. — August (vol. 13, no. 15). — P. 1924—1935. — ISSN 0890-9369. — doi:10.1101/gad.13.15.1924. — PMID 10444591. — PMC 316920.
  9. ↑ Swanson, Kurt A; Knoepfler Paul S; Huang Kai; Kang Richard S; Cowley Shaun M; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Radhakrishnan Ishwar. HBP1 and Mad1 repressors bind the Sin3 corepressor PAH2 domain with opposite helical orientations (англ.) // Nature Structural & Molecular Biology : journal. — United States, 2004. — August (vol. 11, no. 8). — P. 738—746. — ISSN 1545-9993. — doi:10.1038/nsmb798. — PMID 15235594.
  10. ↑ 1 2 Yochum, G S; Ayer D E. Pf1, a novel PHD zinc finger protein that links the TLE corepressor to the mSin3A-histone deacetylase complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — United States, 2001. — July (vol. 21, no. 13). — P. 4110—4118. — ISSN 0270-7306. — doi:10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001. — PMID 11390640. — PMC 87072.
  11. ↑ 1 2 3 4 5 6 Kuzmichev, A; Zhang Y; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Reinberg D. Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidate tumor suppressor p33(ING1) (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — United States, 2002. — February (vol. 22, no. 3). — P. 835—848. — ISSN 0270-7306. — doi:10.1128/MCB.22.3.835-848.2002. — PMID 11784859. — PMC 133546.
  12. ↑ Fleischer, Tracey C; Yun Ui Jeong; Ayer Donald E. Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — United States, 2003. — May (vol. 23, no. 10). — P. 3456—3467. — ISSN 0270-7306. — doi:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003. — PMID 12724404. — PMC 164750.
  13. ↑ 1 2 Laherty, C D; Billin A N., Lavinsky R M., Yochum G S., Bush A C., Sun J M., Mullen T M., Davie J R., Rose D W., Glass C K., Rosenfeld M G., Ayer D E., Eisenman R N. SAP30, a component of the mSin3 corepressor complex involved in N-CoR-mediated repression by specific transcription factors (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — UNITED STATES, 1998. — July (vol. 2, no. 1). — P. 33—42. — ISSN 1097-2765. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80111-2. — PMID 9702189.
  14. ↑ Underhill, C; Qutob M S; Yee S P; Torchia J. A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — UNITED STATES, 2000. — December (vol. 275, no. 51). — P. 40463—40470. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M007864200. — PMID 11013263.

Литература

[править | править код]