SMC2

SMC2
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

4U4P

Идентификаторы
ПсевдонимыSMC2, CAP-E, CAPE, SMC-2, SMC2L1, structural maintenance of chromosomes 2
Внешние IDOMIM: 605576 MGI: 106067 HomoloGene: 4705 GeneCards: SMC2
Расположение гена (человек)
9-я хромосома человека
Хр.9-я хромосома человека[1]
9-я хромосома человека
Расположение в геноме SMC2
Расположение в геноме SMC2
Локус9q31.1Начало104,094,260 bp[1]
Конец104,141,419 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
4-я хромосома мыши
Хр.4-я хромосома мыши[2]
4-я хромосома мыши
Расположение в геноме SMC2
Расположение в геноме SMC2
Локус4 B2|4 28.31 cMНачало52,439,243 bp[2]
Конец52,488,260 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001042550
NM_001042551
NM_001265602
NM_006444

NM_001301412
NM_008017

RefSeq (белок)

NP_001036015
NP_001036016
NP_001252531
NP_006435
NP_006435.2

NP_001288341
NP_032043

Локус (UCSC)Chr 9: 104.09 – 104.14 MbChr 4: 52.44 – 52.49 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

SMC2 или белок структурной поддержки хромосом номер два (англ. Structural maintenance of chromosomes protein 2), также известный как хромосом-ассоцированный полипептид E — белок, который у человека кодируется геном SMC2[5][6]. SMC2 входит в семейство SMC-белков и является основной субъединицей конденсина I и II, крупных белковых комплексов, участвующих в конденсации хромосом и их общей организации[7].

Несколько исследований показали, что SMC2 необходим для деления и пролиферации клеток[8][9].

Длина полипептидной цепи белка составляет 1197 аминокислот, а молекулярная масса — 135656 Да[10].

Будучи одним из 6 эукариотических SMC-белков, SMC2 образует гетеродимер с SMC4 через их шарнирные домены. Образующийся гетеродимер функционирует как гибкое и динамичное ядро голокомплекса, который объединяется с другими регуляторными белками, не относящимися к SMC, образуя конденсин[7]. В конденсине I SMC2 объединяется с CAP-H, CAP-D2 и CAP-G. В конденсине II SMC2 образует комплексы с CAP-H2, CAP-D3 и CAP-G2. Субъединицы CAP-H и CAP-H2 относятся к клейзиновым белкам, аналогичным Scc1, который присутствует в когезине, а CAP-D2, CAP-G, CAP-D3 и CAP-G2 содержат структурные HEAT-повторы[11].

Структура голокомплекса белков конденсина, в котором представлены гетеродимер SMC-2/SMC-4 и дополнительные субъединицы. Также изображен клейзин (синий).

SMC2 работает в составе конденсинового комплекса как регулятор транскрипции, уплотняя реплицированную ДНК перед митотическим делением за счёт сверхспирализации ДНК. SMC2 также участвует в расхождении сестринских хроматид перед анафазой[9].

Взаимодействия

[править | править код]

Показано, что SMC2 взаимодействует с DNMT3B[12].

Клиническое значение

[править | править код]

Синдром Корнелии де Ланге

[править | править код]

Мутации в гене SMC2 были связаны с различными заболеваниями человека, включая синдром Корнелии де Ланге (CdLS), который характеризуется аномалиями развития, когнитивными нарушениями и рядом физических аномалий[13]. Исследование показало, что делеция части длинного плеча 9-й хромосомы (9q31.1-q32) вызывает симптомы, схожие с теми, что наблюдаются у пациентов с CdLS[14]. Эта делеция перекрывает ген, кодирующий SMC2. С CdLS связано множество мутаций в различных генах, однако около 30 % случаев не были связаны ни с одним из известных генов[14]. Проводятся дополнительные исследования для выявления других причин этого синдрома.

Другие исследования показали, что изменения в экспрессии гена SMC2 могут быть вовлечены в развитие и прогрессирование рака. Было установлено, что сверхэкспрессия SMC2 приводит к онкогенезу и злокачественным новообразованиям. В настоящее время некоторые исследования изучают ингибирование SMC2[15] как потенциальную терапевтическую мишень для лечения рака, поскольку ингибирование экспрессии или активности SMC2 может привести к индукции клеточной смерти в раковых клетках.

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136824 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028312 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Schmiesing J.A., Ball AR Jr, Gregson H.C., Alderton J.M., Zhou S., Yokomori K. Identification of two distinct human SMC protein complexes involved in mitotic chromosome dynamics (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — November (vol. 95, no. 22). — P. 12906—12911. — doi:10.1073/pnas.95.22.12906. — PMID 9789013. — PMC 23650.
  6. Entrez Gene: SMC2 structural maintenance of chromosomes 2. Архивировано 5 декабря 2010 года.
  7. 1 2 Eeftens, Jorine M.; Katan, Allard J.; Kschonsak, Marc; Hassler, Markus; de Wilde, Liza; Dief, Essam M.; Haering, Christian H.; Dekker, Cees (2016-03-01). "Condensin Smc2-Smc4 Dimers Are Flexible and Dynamic". Cell Reports (англ.). 14 (8): 1813—1818. doi:10.1016/j.celrep.2016.01.063. ISSN 2211-1247. PMC 4785793. PMID 26904946.
  8. Li, Xixi; Song, Guili; Zhao, Yasong; Ren, Jing; Li, Qing; Cui, Zongbin (September 2021). "Functions of SMC2 in the Development of Zebrafish Liver". Biomedicines (англ.). 9 (9): 1240. doi:10.3390/biomedicines9091240. ISSN 2227-9059. PMC 8465584. PMID 34572426.
  9. 1 2 Dávalos, Verónica; Súarez-López, Lucía; Castaño, Julio; Messent, Anthea; Abasolo, Ibane; Fernandez, Yolanda; Guerra-Moreno, Angel; Espín, Eloy; Armengol, Manel; Musulen, Eva; Ariza, Aurelio; Sayós, Joan; Arango, Diego; Schwartz, Simó (2012-12-21). "Human SMC2 Protein, a Core Subunit of Human Condensin Complex, Is a Novel Transcriptional Target of the WNT Signaling Pathway and a New Therapeutic Target *". Journal of Biological Chemistry (англ.). 287 (52): 43472—43481. doi:10.1074/jbc.M112.428466. ISSN 0021-9258. PMC 3527934. PMID 23095742.
  10. UniProt, O95347 (англ.). Дата обращения: 20 декабря 2023. Архивировано 20 декабря 2023 года.
  11. Losada, Ana; Hirano, Tatsuya (2005-06-01). "Dynamic molecular linkers of the genome: the first decade of SMC proteins". Genes & Development (англ.). 19 (11): 1269—1287. doi:10.1101/gad.1320505. ISSN 0890-9369. PMID 15937217.
  12. Geiman, Theresa M; Sankpal Umesh T., Robertson Andrea K., Chen Yue, Mazumdar Manjari, Heale Jason T., Schmiesing John A., Kim Wankee, Yokomori Kyoko, Zhao Yingming, Robertson Keith D. Isolation and characterization of a novel DNA methyltransferase complex linking DNMT3B with components of the mitotic chromosome condensation machinery (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — England, 2004. — Vol. 32, no. 9. — P. 2716—2729. — doi:10.1093/nar/gkh589. — PMID 15148359. — PMC 419596.
  13. Cornelia de Lange syndrome - About the Disease - Genetic and Rare Diseases Information Center. rarediseases.info.nih.gov. (10 апреля 2023). Дата обращения: 20 декабря 2023. Архивировано 15 мая 2021 года.
  14. 1 2 Cao, Ruixue; Pu, Tian; Fang, Shaohai; Long, Fei; Xie, Jing; Xu, Yuejuan; Chen, Sun; Sun, Kun; Xu, Rang (2015). "Patients Carrying 9q31.1-q32 Deletion Share Common Features with Cornelia de Lange Syndrome". Cellular Physiology and Biochemistry (неопр.). 35 (1): 270—280. doi:10.1159/000369694. ISSN 1015-8987. PMID 25591769. S2CID 41785465. Архивировано 18 апреля 2023. Дата обращения: 20 декабря 2023.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (неизвестный язык) (ссылка)
  15. Montero, Sara; Seras-Franzoso, Joaquin; Andrade, Fernanda; Martinez-Trucharte, Francesc; Vilar-Hernández, Mireia; Quesada, Manuel; Xandri, Helena; Arango, Diego; Abasolo, Ibane; Rafael, Diana; Schwartz, Simo (2020-02-21). "Intracellular Delivery of Anti-SMC2 Antibodies against Cancer Stem Cells". Pharmaceutics (англ.). 12 (2): 185. doi:10.3390/pharmaceutics12020185. ISSN 1999-4923. PMC 7076674. PMID 32098204.