Бестропин 1

Бестропин 1
Идентификаторы
Псевдонимы	BEST1, ARB, BEST, BMD, RP50, TU15B, VMD2, Bestrophin 1, Best1V1Delta2
Внешние ID	OMIM: 607854 MGI: 1346332 HomoloGene: 37895 GeneCards: BEST1
Расположение гена (человек) Хр. 11-я хромосома человека[1] Локус 11q12.3 Начало 61,950,063 bp[1] Конец 61,965,515 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 19-я хромосома мыши[2] Локус 19|19 A Начало 9,962,538 bp[2] Конец 9,978,997 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в inferior olivary nucleus C1 segment pars reticulata pars compacta Наибольшая экспрессия в seminiferous tubule otolith organ utricle vestibular membrane of cochlear duct proximal tubule Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция chloride channel activity intracellular calcium activated chloride channel activity bicarbonate transmembrane transporter activity связывание похожих белков Компонент клетки часть мембраны цитозоль клеточная мембрана basolateral plasma membrane мембрана chloride channel complex Биологический процесс ion transmembrane transport chloride transport regulation of calcium ion transport chloride transmembrane transport transepithelial chloride transport ion transport зрение человека detection of light stimulus involved in visual perception response to stimulus bicarbonate transport Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 7439 24115 Ensembl ENSG00000167995 ENSMUSG00000037418 UniProt O76090 O88870 RefSeq (мРНК) NM_001139443 NM_001300786 NM_001300787 NM_004183 NM_001363591 NM_001363592 NM_001363593 NM_011913 RefSeq (белок) NP_001132915 NP_001287715 NP_001287716 NP_004174 NP_001350520 NP_001350521 NP_001350522 NP_036043 Локус (UCSC) Chr 11: 61.95 – 61.97 Mb Chr 19: 9.96 – 9.98 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Бестропин-1  — белок, который у человека кодируется геном BEST1.^[5][6][7] Он может быть связан с вителиформной макулярной дистрофией .

Функция

BEST1 принадлежит бестропиновому семейству кальций-активируемых анионных каналов, которое включает в себя BEST2 , BEST3 и BEST4. Бестропины являются трансмембранными (ТМ) белками, которымм разделяют гомологический регион с высоким содержанием ароматических остатков, в том числе инвариантный Arg-Phe-Pro (RFP) мотив. Бестропины, как полагают, действуют как хлоридные каналы, которые также могут служить в качестве регуляторов внутриклеточной кальциевой сигнализации.^[8]

Бестропин 1, как было выявлено, проницаем для хлорида, тиоцианата, бикарбоната, глутамата, и ГАМК. Бестропин 1 опосредует высвобождение ГАМК, недавно было продемонстрировано, что он ответственен за тонизацию торможения в мозжечке гранулярных клеток,^[9] и был связан с патологией болезни Альцгеймера.^[10]

Генная структура

В бестропине гены делят консервативную генную структуру, с почти одинакового размера 8 RFP-ТМ кодируемыми доменом экзонами и высоко консервативными экзон-интронными границами. Каждый из 4 генов бестропина имеет 3 первичных уникальных конца переменной длины.^[7][11][12]

BEST1, как было показано с помощью двух независимых исследований, регулирует ассоциированный с микрофтальмией транскрипционный фактор.^[13][14]

Взаимодействия

Бестропин 1, как было выявлено, взаимодействуют с PPP2CA .^[15]

Антагонисты

• Verteporfin^[16]

Примечания

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000167995 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037418 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Stone E.M., Nichols B.E., Streb L.M., Kimura A.E., Sheffield V.C. Genetic linkage of vitelliform macular degeneration (Best's disease) to chromosome 11q13 (англ.) // Nature Genetics : journal. — 1993. — June (vol. 1, no. 4). — P. 246—250. — doi:10.1038/ng0792-246. — PMID 1302019.
6. Barro Soria R., Spitzner M., Schreiber R., Kunzelmann K. Bestrophin 1 enables Ca²⁺ activated Cl⁻ conductance in epithelia (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2006. — September (vol. 284, no. 43). — P. 29405—29412. — doi:10.1074/jbc.M605716200. — PMID 17003041. — PMC 2785573.
7. Entrez Gene: BEST1 bestrophin 1  (неопр.). Архивировано 6 марта 2010 года.
8. Hartzell H.C., Qu Z., Yu K., Xiao Q., Chien L.T. Molecular physiology of bestrophins: multifunctional membrane proteins linked to best disease and other retinopathies (англ.) // Physiological Reviews^[англ.] : journal. — 2008. — April (vol. 88, no. 2). — P. 639—672. — doi:10.1152/physrev.00022.2007. — PMID 18391176.
9. Lee S., Yoon B.E., Berglund K., Oh S.J., Park H., Shin H.S., Augustine G.J., Lee C.J. Channel-mediated tonic GABA release from glia (англ.) // Science. — 2010. — November (vol. 330, no. 6005). — P. 790—796. — doi:10.1126/science.1184334. — PMID 20929730.
10. Jo Seonmi, Yarishkin Oleg, Hwang Yu Jin, Chun Ye Eun, Park Mijeong, Woo Dong Ho, Bae Jin Young, Kim Taekeun, Lee Jaekwang, Chun Heejung, Park Hyun Jung, Lee Da Yong, Hong Jinpyo, Kim Hye Yun, Oh Soo-Jin, Park Seung Ju, Lee Hyo, Yoon Bo-Eun, Kim YoungSoo, Jeong Yong, Shim Insop, Bae Yong Chul, Cho Jeiwon, Kowall Neil W, Ryu Hoon, Hwang Eunmi, Kim Daesoo, Lee C Justin. GABA from reactive astrocytes impairs memory in mouse models of Alzheimer's disease // Nature Medicine. — 2014. — 29 июня (т. 20, № 8). — С. 886—896. — ISSN 1078-8956. — doi:10.1038/nm.3639. [исправить]
11. Stöhr H., Marquardt A., Nanda I., Schmid M., Weber B.H. Three novel human VMD2-like genes are members of the evolutionary highly conserved RFP-TM family (англ.) // European Journal of Human Genetics^[англ.] : journal. — 2002. — April (vol. 10, no. 4). — P. 281—284. — doi:10.1038/sj.ejhg.5200796. — PMID 12032738.
12. Tsunenari T., Sun H., Williams J., Cahill H., Smallwood P., Yau K.W., Nathans J. Structure-function analysis of the bestrophin family of anion channels (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — October (vol. 278, no. 42). — P. 41114—41125. — doi:10.1074/jbc.M306150200. — PMID 12907679. — PMC 2885917.
13. Esumi N., Kachi S., Campochiaro P.A., Zack D.J. VMD2 promoter requires two proximal E-box sites for its activity in vivo and is regulated by the MITF-TFE family (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2007. — Vol. 282, no. 3. — P. 1838—1850. — doi:10.1074/jbc.M609517200. — PMID 17085443.
14. Hoek K.S., Schlegel N.C., Eichhoff O.M., Widmer D.S., Praetorius C., Einarsson S.O., Valgeirsdottir S., Bergsteinsdottir K., Schepsky A., Dummer R., Steingrimsson E. Novel MITF targets identified using a two-step DNA microarray strategy (англ.) // Pigment Cell & Melanoma Research^[англ.] : journal. — 2008. — Vol. 21, no. 6. — P. 665—676. — doi:10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x. — PMID 19067971.
15. Marmorstein L.Y., McLaughlin P.J., Stanton J.B., Yan L., Crabb J.W., Marmorstein A.D. Bestrophin interacts physically and functionally with protein phosphatase 2A (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 34. — P. 30591—30597. — doi:10.1074/jbc.M204269200. — PMID 12058047.
16. Rao PR. Identification of novel selective antagonists for Bestrophin-1 protein by homology modeling and molecular docking. International Journal of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences 2012; 4(S4):195-200.  (неопр.) Дата обращения: 17 января 2015. Архивировано 14 июля 2014 года.

Литература

• White K., Marquardt A., Weber B.H. VMD2 mutations in vitelliform macular dystrophy (Best disease) and other maculopathies (англ.) // Human Mutation^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 15, no. 4. — P. 301—308. — doi:10.1002/(SICI)1098-1004(200004)15:4<301::AID-HUMU1>3.0.CO;2-N. — PMID 10737974.
• Nordström S., Barkman Y. Hereditary maculardegeneration (HMD) in 246 cases traced to one gene-source in central Sweden (англ.) // Hereditas^[англ.] : journal. — 1977. — Vol. 84, no. 2. — P. 163—176. — doi:10.1111/j.1601-5223.1977.tb01394.x. — PMID 838599.
• Forsman K., Graff C., Nordström S., et al. The gene for Best's macular dystrophy is located at 11q13 in a Swedish family (англ.) // Genetics^[англ.] : journal. — Genetics Society of America^[англ.], 1992. — Vol. 42, no. 3. — P. 156—159. — doi:10.1111/j.1399-0004.1992.tb03229.x. — PMID 1395087.
• Stöhr H., Marquardt A., Rivera A., et al. A gene map of the Best's vitelliform macular dystrophy region in chromosome 11q12-q13.1 (англ.) // Genome Research : journal. — 1998. — Vol. 8, no. 1. — P. 48—56. — doi:10.1101/gr.8.1.48. — PMID 9445487. — PMC 310689.
• Petrukhin K., Koisti M.J., Bakall B., et al. Identification of the gene responsible for Best macular dystrophy (англ.) // Nature Genetics : journal. — 1998. — Vol. 19, no. 3. — P. 241—247. — doi:10.1038/915. — PMID 9662395.
• Pennisi E. New gene found for inherited macular degeneration (англ.) // Science. — 1998. — Vol. 281, no. 5373. — P. 31. — doi:10.1126/science.281.5373.31. — PMID 9679014.
• Marquardt A., Stöhr H., Passmore L.A., et al. Mutations in a novel gene, VMD2, encoding a protein of unknown properties cause juvenile-onset vitelliform macular dystrophy (Best's disease) (англ.) // Human Molecular Genetics^[англ.] : journal. — Oxford University Press, 1998. — Vol. 7, no. 9. — P. 1517—1525. — doi:10.1093/hmg/7.9.1517. — PMID 9700209.
• Caldwell G.M., Kakuk L.E., Griesinger I.B., et al. Bestrophin gene mutations in patients with Best vitelliform macular dystrophy (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1999. — Vol. 58, no. 1. — P. 98—101. — doi:10.1006/geno.1999.5808. — PMID 10331951.
• Bakall B., Marknell T., Ingvast S., et al. The mutation spectrum of the bestrophin protein--functional implications (англ.) // Human Genetics : journal. — 1999. — Vol. 104, no. 5. — P. 383—389. — doi:10.1007/s004390050972. — PMID 10394929.
• Allikmets R., Seddon J.M., Bernstein P.S., et al. Evaluation of the Best disease gene in patients with age-related macular degeneration and other maculopathies (англ.) // Human Genetics : journal. — 1999. — Vol. 104, no. 6. — P. 449—453. — doi:10.1007/s004390050986. — PMID 10453731.
• Palomba G., Rozzo C., Angius A., et al. A novel spontaneous missense mutation in VMD2 gene is a cause of a best macular dystrophy sporadic case (англ.) // American Journal of Ophthalmology^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 129, no. 2. — P. 260—262. — doi:10.1016/S0002-9394(99)00327-X. — PMID 10682987.
• Lotery A.J., Namperumalsamy P, Jacobson S.G., et al. Mutation analysis of 3 genes in patients with Leber congenital amaurosis (англ.) // JAMA Ophthalmology^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 118, no. 4. — P. 538—543. — doi:10.1001/archopht.118.4.538. — PMID 10766140.
• Lotery A.J., Munier F.L., Fishman G.A., et al. Allelic variation in the VMD2 gene in best disease and age-related macular degeneration (англ.) // Investigative Ophthalmology & Visual Science^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 41, no. 6. — P. 1291—1296. — PMID 10798642.
• Krämer F., White K., Pauleikhoff D., et al. Mutations in the VMD2 gene are associated with juvenile-onset vitelliform macular dystrophy (Best disease) and adult vitelliform macular dystrophy but not age-related macular degeneration (англ.) // European Journal of Human Genetics^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 8, no. 4. — P. 286—292. — doi:10.1038/sj.ejhg.5200447. — PMID 10854112.
• Marmorstein A.D., Marmorstein L.Y., Rayborn M., et al. Bestrophin, the product of the Best vitelliform macular dystrophy gene (VMD2), localizes to the basolateral plasma membrane of the retinal pigment epithelium (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — Vol. 97, no. 23. — P. 12758—12763. — doi:10.1073/pnas.220402097. — PMID 11050159. — PMC 18837.
• Marchant D., Gogat K., Boutboul S., et al. Identification of novel VMD2 gene mutations in patients with best vitelliform macular dystrophy (англ.) // Human Mutation^[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 17, no. 3. — P. 235. — doi:10.1002/humu.9. — PMID 11241846.
• Eksandh L., Bakall B., Bauer B., et al. Best's vitelliform macular dystrophy caused by a new mutation (Val89Ala) in the VMD2 gene (англ.) // Ophthalmic Genet. : journal. — 2001. — Vol. 22, no. 2. — P. 107—115. — doi:10.1076/opge.22.2.107.2226. — PMID 11449320.
• Sun H., Tsunenari T., Yau K.W., Nathans J. The vitelliform macular dystrophy protein defines a new family of chloride channels (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 6. — P. 4008—4013. — doi:10.1073/pnas.052692999. — PMID 11904445. — PMC 122639.
• Xiao Q., Yu K., Cui Y.Y., Hartzell H.C. Dysregulation of human bestrophin-1 by ceramide-induced dephosphorylation (англ.) // J Physiol. : journal. — 2009. — Vol. 587, no. 18. — P. 4379—4391. — doi:10.1113/jphysiol.2009.176800. — PMID 19635817. — PMC 2766645.
• Xiao Q., Prussia A., Yu K., Cui Y.Y., Hartzell H.C. Regulation of bestrophin Cl channels by calcium: role of the C terminus (англ.) // J Gen Physiol. : journal. — 2008. — Vol. 132, no. 6. — P. 681—692. — doi:10.1085/jgp.200810056. — PMID 19029375. — PMC 2585866.