В отличие от канальных реакторов, в корпусных применяется специальный герметичный корпус. Так как давление в первом контуре может доходить до 160 атм (ВВЭР-1000), он весьма трудоёмок в изготовлении. Процесс замены ядерного топлива в таком реакторе затруднён, он требует полной остановки и частичной разборки реактора. Несмотря на недостатки, корпусные реакторы в настоящее время применяются наиболее широко. В России это ВВЭР, в других странах — PWR и BWR.
реакторы с водой под давлением принципиально не имеют положительных эффектов реактивности;
небольшое число дополнительных конструкционных материалов, присутствующих в активной зоне и поглощающих нейтроны;
корпусные реакторы имеют защитную оболочку, выполнить которую для канальных реакторов не представляется возможным из-за большой разветвлённости труб реакторного отделения.
наличие сложного в изготовлении и габаритного герметичного корпуса
ограничение на размер активной зоны достижением предельного состояния прочности, и, как следствие, ограничение максимальной мощности; также габариты корпуса ограничены требованиями железнодорожной перевозки;
невозможность частичной перегрузки тепловыделяющих сборок, то есть для замены топлива требуется полная остановка реактора, дренирование теплоносителя, демонтаж системы привода стержней, снятие крышки реактора и т.д.