Матриксная металлопротеиназа 9

Матриксная металлопротеиназа 9
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1GKC, 1GKD, 1ITV, 1L6J, 2OVX, 2OVZ, 2OW0, 2OW1, 2OW2, 4H1Q, 4H2E, 4H3X, 4H82, 4HMA, 4JIJ, 4JQG, 4WZV, 4XCT, 5CUH, 5I12
Идентификаторы
Псевдонимы	MMP9, CLG4B, GELB, MANDP2, MMP-9, 92 kDa type IV collagenase, 92 kDa gelatinase, gelatinase B, matrix metallopeptidase 9
Внешние ID	OMIM: 120361 MGI: 97011 HomoloGene: 3659 GeneCards: MMP9
Расположение гена (человек) Хр. 20-я хромосома человека[1] Локус 20q13.12 Начало 46,008,908 bp[1] Конец 46,016,561 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 2-я хромосома мыши[2] Локус 2 H3|2 85.27 cM Начало 164,782,700 bp[2] Конец 164,797,770 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в skin of hip Наибольшая экспрессия в tibiofemoral joint body of femur Dermatocranium trophoblast giant cell Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция collagen binding zinc ion binding связывание с ионом металла peptidase activity связывание с белками плазмы связывание похожих белков гидролазная активность metallopeptidase activity endopeptidase activity serine-type endopeptidase activity metalloendopeptidase activity Компонент клетки внеклеточный матрикс экзосома внеклеточное пространство tertiary granule lumen ficolin-1-rich granule lumen внеклеточная область collagen-containing extracellular matrix Биологический процесс skeletal system development negative regulation of cation channel activity positive regulation of protein phosphorylation endodermal cell differentiation negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway оссификация negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway ephrin receptor signaling pathway extracellular matrix disassembly негативная регуляция апоптоза протеолиз macrophage differentiation positive regulation of keratinocyte migration positive regulation of apoptotic process collagen catabolic process positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria positive regulation of receptor binding positive regulation of DNA binding positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway embryo implantation leukocyte migration positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation extracellular matrix organization positive regulation of cell migration neutrophil degranulation cellular response to reactive oxygen species cellular response to cadmium ion cytokine-mediated signaling pathway regulation of neuroinflammatory response negative regulation of epithelial cell differentiation involved in kidney development response to amyloid-beta Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 4318 17395 Ensembl ENSG00000100985 ENSMUSG00000017737 UniProt P14780 P41245 RefSeq (мРНК) NM_004994 NM_013599 RefSeq (белок) NP_004985 NP_038627 Локус (UCSC) Chr 20: 46.01 – 46.02 Mb Chr 2: 164.78 – 164.8 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Матриксная металлопротеиназа 9 (MMP9; «желатиназа B») - один из ферментов, участвующих в ремоделинге структур внеклеточного матрикса.

Клиническое значение

По данным одного исследования, один missense-полиморфизм гена MMP9 ассоциирован с риском развития межпозвоночной грыжи поясничного отдела^[5].

См. также

• MMP2, «желатиназа A»

Примечания

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100985 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000017737 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Hirose Y., Chiba K., Karasugi T., Nakajima M., Kawaguchi Y., Mikami Y., Furuichi T., Mio F., Miyake A., Miyamoto T., Ozaki K., Takahashi A., Mizuta H., Kubo T., Kimura T., Tanaka T., Toyama Y., Ikegawa S. A functional polymorphism in THBS2 that affects alternative splicing and MMP binding is associated with lumbar-disc herniation (англ.) // Am. J. Hum. Genet.^[англ.] : journal. — 2008. — May (vol. 82, no. 5). — P. 1122—1129. — doi:10.1016/j.ajhg.2008.03.013. — PMID 18455130. — PMC 2427305.