По преданию, монастырь был основан апостолом Варфоломеем в I веке и его ученик Кумс (хи) был назначен его священником. Вначале, вероятно, это было небольшое сооружение, похожее на часовню, которое было перестроено и расширено после обращения Армении в христианство. Монастырь служил центром прихода Гохтн с раннего средневековья до 1838 года. В монастыре хранились мощи: десница апостола Фомы, подаренная католикосом Епремом I в 1821 году, мощи святой Гаяне (фр) и десница Иакова Низибийского. В монастыре было кладбище XIII-XIX веков, которое было расположено примерно в 250 м к северо-востоку от комплекса[3].
Монастырский комплекс состоял из храма, колокольни, стены и подсобных построек. Церковь монастыря, вероятно, была повреждена землетрясением 1679 года, и в 1694 году была построена заново из полированного базальта и красноватого фельзита, с семигранной скинией внутри и куполообразной базиликой с четырьмя крестами[1][3][4].
В 1919 году турецкие войска вырезали армянское население города и разрушили Агулис. Они разграбили монастырь, который впоследствии был заброшен и разрушен[5][6]. В настоящее время[когда?] на месте монастыря построена мечеть[7][8].
↑N.010, 38.96301500N / 45.98236690E, SiteSt. Tovma Monastery of Agulis(амер. англ.). ArcGIS StoryMaps (31 августа 2022). Дата обращения: 4 августа 2023. Архивировано 5 августа 2023 года.
↑ 12HOVHANNES HAKHNAZARIAN.GOGHTAN DISTRICT(англ.). .. SCIENTIFIC COUNCIL OF RESEARCH ON ARMENIAN ARCHITECTURE (RAA) FOUNDATION (Yerevan, 2013). Дата обращения: 21 октября 2021. Архивировано 16 июля 2021 года.
↑Richard G. Hovannisian.The Republic of Armenia. — Berkeley, University of California Press, 1971. — 638 с. — ISBN 978-0-520-01805-1, 978-0-520-04186-8, 978-0-520-08803-0, 978-0-520-08804-7.
↑Bert Vaux.The Armenian dialect of Agulis (англ.) // Zok. — 2008. — Vol. In between Paris and Fresno: Armenian studies in honor of Dickran Kouymjian. City of Agulis, located in southeastern Nakhichevan. Following the massacre of the Armenian population of Agulis by the Turkish army in 1919. — P. 283–301. Архивировано 7 марта 2023 года.
Հակոբյան Թ. Խ., Մելիք-Բախշյան Ստ. Տ., Բարսեղյան Հ. Խ., Հայաստանի և հարակից շրջանների տեղանունների բառարան, հ. 1 [Դ-Կ] (խմբ. Մանուկյան Լ. Գ.), Երևան, «Երևանի Համալսարանի Հրատարակչություն», 1986, էջ 27 — 1008 էջ։
Ստեփան Մելիք-Բախշյան, Հայոց պաշտամունքային վայրեր, Երևան, «ԵՊՀ հրատարակչություն», 2009 — 6, եր 6 — 432 + 10 ն ներդիր էջ. — 500 ատ։
Ղևոնդ Ալիշան, Սիսական, էջ 326
Հ. Շահխաթունեանց, Ստորագրություն, 325
Ե. Լալայան, Գողթն, էջ 69
Մ. Փափազյան. Հնութիւնք Հայրենեաց, Դ., Թ. 287 вон
Արգամ Այվազյան, Նախիջևանի ԻՍՍՀ հայկական հուշարձանները։ Համահավաք ցուցակ (խմբ. Խմբ. Բ. Ա. Ուլուբաբյան), Երևան, «Հայաստան», 1986 — 21, եր 21 — 224 էջ։
По данным исследовательской группы Caucasus Heritage Watch, в Нахичевани в период 1997—2011 годов было полностью уничтожено методом «стирания с поверхности земли» 68 армянских церквей и монастырей и 40 кладбищ