Нокдаун гена

У этого термина существуют и другие значения, см. нокдаун.

Нокдаун гена (англ. Gene knockdown) — методика, позволяющая снизить экспрессию одного или нескольких генов при помощи изменения соответствующей последовательности нуклеотидов либо при помощи короткого олигонуклеотида, комплементарного соответствующей молекуле мРНК. Метод нокдауна генов относится к методам обратной генетики. В случае, когда изменяется последовательность гена, организм называют нокаутным по данному гену. В случае использования коротких олигонуклеотидов, комплементарных соответствующим мРНК или связывающимися с последовательностью нуклеотидов в ДНК, нокдаун гена приводит к временному изменению параметров экспрессии гена, без внесения изменений в структуру хромосом и последовательности ДНК гена.

В случае кратковременного нокдауна, связывание олигонуклеотида с геном или транскриптами, понижает экспрессию из-за блокировки транскрипции, трансляции или деградации мРНК (например, по пути РНК-интерференции), также может нарушаться сплайсинг пре-мРНК.[1][2] Исследователи изучают влияние выключения гена или снижения его экспрессии на фенотип организма и сравнивают с нормальными особями. Кратковременные нокдауны генов часто используют в биологии развития, так как олигонуклеотиды легко могут быть введены в зиготу и будут попадать во все дочерние клетки в ходе эмбрионального развития.[3]

Примечания

[править | править код]
  1. ↑ Summerton, J. Morpholino, siRNA, and S-DNA Compared: Impact of Structure and Mechanism of Action on Off-Target Effects and Sequence Specificity (англ.) // Med Chem. : journal. — 2007. — Vol. 7, no. 7. — P. 651—660. Архивировано 7 сентября 2015 года.
  2. ↑ Summerton, J. Morpholino Antisense Oligomers: The Case for an RNase-H Independent Structural Type (англ.) // Biochimica et Biophysica Acta[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 1489, no. 1. — P. 141—158. — PMID 10807004.
  3. ↑ Nasevicius, A; Ekker S.C. Effective targeted gene 'knockdown' in zebrafish (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2000. — Vol. 26, no. 2. — P. 216—220. — doi:10.1038/79951. — PMID 11017081.

См. также

[править | править код]