Humuya (španjolski: Río Humuya) je rijeka u Hondurasu velika pritoka rijeke Ulúa[1] duga nekih 180 km.
Humuya izvire u masivu Cordillera de Montecillos[1]u Departmanu Francisco Morazan. Od tamo rijeka teče preko Departmana Comayagua, preko grada Comayagua u pravcu sjeveroistoka. U donjem dijelu svog toka u Departmanu Cortés protiče kroz veliko akumulacijsko jezero Francisco Morazan, koje je formirano izgradnjom brane između 1980.- 1985., duge 300 i visoke 301 metara.[2]
To jezero veliko 94 km², kapaciteta 5 700 miliona m³ vode, podignuto je za potrebe hidroelektrane El Cajón snage 300 MW, ali i zbog navodnjavanja doline Valle de Sula.[2]
Nakon jezera svojim tokom formira granicu između departmana Yoro i Cortés.[1] Tako dotiče do ušća u rijeku Ulúa, sjeverozapadno od grada El Progresa.