Dizajn bielkovín

Bielkovina Top7 bola jedna z prvých dizajnovaných bielkovín, ktorých tvar nebol nikdy pozorovaný v prírode

Dizajn bielkovín alebo dizajn proteínov je racionálny dizajn nových molekúl bielkovín za účelom dizajnu novej aktivity, správania alebo použitia a za účelom rozšírenia základného pochopenia funkcie bielkovín.[1] Bielkoviny možno dizajnovať „od nuly“ (de novo dizajn) alebo upravovaním bielkovín so známou štruktúrou a sekvenciou (redizajn bielkovín). Racionálny dizajn bielkovín sa zaoberá predikciou sekvencií, ktoré sa budú skladať do požadovaného tvaru. Tieto sekvencie potom možno experimentálne overiť pomocou rôznych metód, medzi ktoré patria syntéza peptidov, miestne-cielená mutagenéza alebo syntéza umelých génov.

Racionálny dizajn bielkovín začal okolo polovice 70. rokov 20. storočia.[2] V posledných rokoch sa však objavilo mnoho príkladov úspešného racionálneho dizajnu bielkovín rozpustných vo vode a dokonca i transmembránových peptidov a bielkovín, čiastočne vďaka lepšiemu pochopeniu príspevku rôznych faktorov k stabilite bielkovinovej štruktúry a zároveň vďaka vývoju lepších počítačových metód.

Referencie

[upraviť | upraviť zdroj]
  1. Minimalist design of peptide and protein catalysts [online]. American Chemical Society, 19 March 2018, [cit. 2018-03-22]. Dostupné online.
  2. RICHARDSON, JS; Richardson, DC. The de novo design of protein structures.. Trends in Biochemical Sciences, July 1989, s. 304–9. DOI10.1016/0968-0004(89)90070-4. PMID 2672455.

Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Protein design na anglickej Wikipédii.