Feja në Guinea-Bissau është e larmishme, pa asnjë fe të veçantë që përbën shumicën absolute të popullsisë. Islami është besimi më i përhapur dhe popullata të konsiderueshme të të krishterëve dhe adhuruesve të feve tradicionale afrikane janë gjithashtu të pranishme në vend.
CIA World Factbook (vlerësimi i vitit 2020) thotë se rreth 46.1% e popullsisë janë myslimanë, 30.6% i përmbahen besimeve tradicionale, 18.9% janë të krishterë dhe 4.4% janë jofetarë ose praktikojnë fe të tjera. Ndërkohë, Departamenti Amerikan i Shtetit përmend se vlerësimet ndryshojnë shumë dhe citon të dhënat e Forumit Pew (2020) të 46% myslimanë, 31% praktikave fetare indigjene dhe 19% të krishterë.
Të krishterët gjenden kryesisht përgjatë rajoneve bregdetare dhe i përkasin Kishës Katolike Romake , dhe kishave të ndryshme protestante. Në vitin 2017, islami sunit, duke përfshirë atë të orientuar nga sufi, ishin më të përqendruar në pjesët veriore dhe verilindore të vendit, ndërsa praktikuesit e besimeve tradicionale fetare indigjene jetojnë përgjithësisht në të gjitha, përveç pjesëve veriore të vendit.