Sipas regjistrimit të vitit 2012, Islami është feja më e ndjekur në Niger dhe praktikohet nga 99% e popullsisë. Sipas Pew, afërsisht 80% e muslimanëve janë sunitë të shkollës së jurisprudencës Maliki, ndërsa 20% janë muslimanë jo-fetare. Fe të tjera të praktikuara në Niger përfshijnë Animizmin dhe Krishterimin .
Islami në Niger përbën shumicën dërrmuese të adhuruesve fetarë të kombit. Besimi praktikohet nga të paktën 95% e popullsisë, megjithëse kjo shifër ndryshon sipas burimit dhe përqindjes së popullsisë që klasifikohet si Animiste. Regjistrimi zyrtar i vitit 2012 zbuloi se 99.3% e popullsisë vetë-identifikohej si myslimane. Shumica e popullsisë muslimane e identifikon veten si sunite Shumë nga komunitetet që vazhdojnë të praktikojnë elemente të feve tradicionale e bëjnë këtë brenda një kuadri të besimit sinkretik islam, duke i bërë të vështira statistikat e dakorduara. Islami në Niger, ndonëse daton më shumë se një mijëvjeçar, fitoi dominim mbi fetë tradicionale vetëm në shekullin e 19-të dhe në fillim të shekullit të 20-të dhe është shënuar nga ndikimet e shoqërive fqinje. Vëllazëritë sufi janë bërë organizata dominuese myslimane, si pjesa më e madhe e Afrikës Perëndimore. Pavarësisht kësaj, një sërë interpretimesh të Islamit bashkëjetojnë – kryesisht në paqe – me njëri-tjetrin si dhe me pakicat e besimeve të tjera. Qeveria e Nigerit është laike në ligj, ndërkohë që njeh rëndësinë e Islamit për shumicën dërrmuese të qytetarëve të saj.
Një përqindje e vogël e popullsisë praktikon animizëm ose besime fetare tradicionale indigjene . Studimet vlerësojnë se praktikues të tillë numërojnë rreth 4.11% të popullsisë totale në vitin 2020, numra të tillë mund të jenë mashtrues pasi ka një shkallë të lartë sinkretizmi brenda komuniteteve myslimane në të gjithë vendin. Megjithatë, sinkretizmi është bërë më pak i zakonshëm gjatë dekadës së fundit. Regjistrimi zyrtar i vitit 2012 zbuloi se vetëm 0.2% e popullsisë (34,786 të anketuar) u vetëidentifikuan si Animist.
Besimet e fesë tradicionale afrikane përfshijnë festivale dhe tradita (të tilla si kulti Bori ) të praktikuara nga disa komunitete sinkretike myslimane (në disa zona Hausa si dhe midis disa baritarëve Toubou dhe Wodaabe ), në krahasim me disa komunitete të vogla që ruajnë periudhën e tyre para-islame. Feja. Këto përfshijnë komunitetin Maouri (ose Arna, fjala Hausa për "pagan") në Dogondoutci në jug-jugperëndim dhe Manga që flasin kanuri pranë Zinder, të cilët praktikojnë variacione të fesë para-islamike Hausa Maguzawa . Ekzistojnë gjithashtu disa komunitete të vogla të fesë tradicionale afrikane Boudouma dhe Songhay në jugperëndim.
Krishterimi fillimisht kontaktoi Nigerin me zgjerimin kolonial francez, dhe pasuesit e tij përfshijnë besimtarë vendas nga familjet e arsimuara, elita dhe koloniale, si dhe emigrantë nga vendet fqinje bregdetare, veçanërisht Benini, Togo dhe Gana . Të krishterët, si katolikë dhe protestantë, përbëjnë më pak se 1% të popullsisë. Regjistrimi zyrtar i vitit 2012 zbuloi se 0.3% e popullsisë (56,856 të anketuar) ishin të krishterë. Një vlerësim i mëvonshëm ka të krishterët në 0.24%, të ndarë në mënyrë të barabartë midis katolikëve, protestantëve dhe besimeve të tjera.
Në vitin 2007, të krishterët ishin kryesisht të pranishëm në Maradi, Dogondoutchi, Niamey dhe qendra të tjera urbane me popullsi të emigrantëve.
Misioni i parë katolik u themelua në vitin 1931, ndërsa misionarët e parë protestantë erdhën në Zinder në 1924 dhe në Tibiri disa vjet më vonë. Në fund të viteve 1970, kishte rreth 12,000 të konvertuar katolikë dhe 3,000 protestantë në Niger, duke përfshirë popullsinë e krishterë së bashku me të huajt.
Nigeri ka një histori të marrëdhënieve të mira midis shumicës së besimtarëve myslimanë dhe besimeve shumë më të vogla të pakicës. Në vitin 2008, Kryepeshkopi Katolik Romak i Niamey Mgr Michel Cartatéguy u citua në shtyp të ketë thënë se Nigeri është një nga "shembujtë më të mirë" të bashkëjetesës dhe bashkëpunimit midis të krishterëve dhe myslimanëve.
Në janar 2015, protestuesit myslimanë dogjën kisha dhe makina dhe sulmuan bizneset e lidhura me Francën në të gjithë Nigerin të shtunën, në protesta të dhunshme kundër publikimit të një karikature të Muhamedit në kopertinën e revistës Charlie Hebdo.