Otvoreno stablo života

Open Tree of Life
Veb-adresaopentreeoflife.org
Komercijalnostno
Registracijane traži se
Dostupan naEngleski
PokrenutSeptembar 2015
Trenutni statusactivno

Otvoreno stablo života je onlajn filogenetsko stablo života – zajednički napor, koji finansira Nacionalna naučna fondacija.[1][2] Prvi nacrt, uključujući 2,3 miliona vrsta, objavljen je u septembru 2015. godine.[3] Interaktivni grafikon omogućava korisniku da zumira taksonomske klasifikacije, filogenetska stabla i informacije o čvoru. Klikom na vrstu vraća se izvorna i referentna taksonomija.

Stablo života u čvoru sukariota

Pristup

[уреди | уреди извор]

Projekat koristi pristup superstabla da generiše jedno filogenetsko stablo (dostupno na tree.opentreeoflife.org[4] iz sveobuhvatne taksonomije i anotiranog skupa objavljenih filogenetskih procena.

Taksonomija je kombinacija nekoliko velikih klasifikacija koje su proizveli drugi projekti; kreira se pomoću softverskog alata koji se zove „smašer“.[5] Dobijena taksonomija se naziva taksonomija otvorenog stabla (OTT) i može se pretraživati na mreži.[6]

Reference

[уреди | уреди извор]
  1. ^ Hinchliff CE, Smith SA, Allman JF, Burleigh JG, Chaudhary R, Coghill LM, et al. (октобар 2015). „Synthesis of phylogeny and taxonomy into a comprehensive tree of life”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112 (41): 12764—9. Bibcode:2015PNAS..11212764H. PMC 4611642 Слободан приступ. PMID 26385966. doi:10.1073/pnas.1423041112 Слободан приступ. 
  2. ^ „Assembling, Visualizing, and Analyzing the Tree of Life”. National Science Foundation (NSF). Приступљено 2016-02-11. 
  3. ^ Pennisi, Elizabeth (21. 9. 2015). „First comprehensive tree of life shows how related you are to millions of species”. Science Magazine. 
  4. ^ „opentree”. Open Tree of Life developers. 
  5. ^ Rees JA, Cranston K (2017). „Automated assembly of a reference taxonomy for phylogenetic data synthesis”. Biodiversity Data Journal. 5 (5): e12581. PMC 5515096 Слободан приступ. PMID 28765728. doi:10.3897/BDJ.5.e12581. 
  6. ^ „tree.opentreeoflife.org”.