Bacillus amyloliquefaciens

Bacillus amyloliquefaciens
Systematik
DomänBakterier
StamFirmicutes
KlassBacilli
OrdningBacillales
FamiljBacillaceae
SläkteBacillus
ArtAmyloliquefaciens
Vetenskapligt namn
§ Bacillus amyloliquefaciens
AuktorFukumoto, 1943

Bacillus amyloliquefaciens är en grampositiv stavformad bakterie släktet Bacillus som är källan till BamHI-restriktionsenzymet. Den förekommer ofta i jord ute i naturen. Bakterien syntetiserar också ett naturligt antibiotiskt protein barnase, ett brett studerat ribonukleas som bildar ett välkänt tätt komplex med sin intracellulära hämmare barstar, och plantazolicin, ett antibiotikum med selektiv aktivitet mot Bacillus anthracis.[1]

Det används inom jordbruk, vattenbruk och hydrokultur för att bekämpa rotpatogener som Ralstonia solanacearum,[2][3] Pythium,[4] Rhizoctonia solani,[5] Alternaria tenuissima[6] och Fusarium[7][8] samt förbättra rottoleransen mot saltstress.[9]De anses vara en tillväxtfrämjande rhizobakterier och har förmågan att snabbt kolonisera rötter.[10]

Upptäckt och namn

[redigera | redigera wikitext]

Bacillus amyloliquefaciens upptäcktes i jord 1943 av en japansk forskare vid namn Fukumoto,[11] som gav bakterien dess namn eftersom den producerade (faciens) ett flytande amylas (amylo).

Användning

[redigera | redigera wikitext]

Alfa-amylas från B. amyloliquefaciens används ofta vid stärkelsehydrolys. Det är också en källa till subtilisin, som katalyserar nedbrytningen av proteiner på liknande sätt som trypsin.

Lantbruk

[redigera | redigera wikitext]

Bacillus amyloliquefaciens anses vara en rotkoloniserande biokontrollbakterie och används för att bekämpa vissa växtrotpatogener inom jordbruk, vattenbruk och hydroponik. Det har visat sig ge fördelar för växter i både jord och hydroponiska tillämpningar. Det agerar mot bakteriella[12] och svamppatogener, och kan förhindra infektion genom konkurrensutslagning eller konkurrera ut den oönskade patogenen.[2] Det har visat sig vara effektivt mot flera rotpatogener som skadar jordbrukets avkastning i jord och hydroponier, såsom Ralstonia solanacearum i cannabis sativa-hampa, tomater,[2][3][13] Rhizoctonia solani i sallad,[5] Pythium i cannabis sativa-hampa & tomater,[4] Alternaria tenuissima i engelsk murgröna[6] och Fusarium i bananer och gurkor.[7][8] Det verkar också förbättra rottoleransen mot abiotisk stress, vilket gör att växter som majs kan tolerera höga saltkoncentrationer i hydroponiska applikationer, samtidigt som det minskar saltkoncentrationerna i växtvävnaden.[9]

Status som art

[redigera | redigera wikitext]

Från1940-talet till 1980-talet diskuterade bakteriologer huruvida B. amyloliquefaciens var en separat art eller en underart av Bacillus subtilis eller inte. Ärendet avgjordes 1987 då det fastställdes att det var en separat art.[14]

I American Type Culture Collection är numret för B. amyloliquefaciens 23350.[15]

Bacillus amyloliquefaciens FZB42, tillverkaren av antibiotikumet plantazolicin med ultrasnävt spektrum, omklassificerades 2015 till B. velezensis NRRL B-41580T (tillsammans med B. methylotrophicus KACC 13015 T och B. oryzicola2 KACC) typ 1 och B. oryzicola2 KACC-typ 1.[16]

Referenser

[redigera | redigera wikitext]
Den här artikeln är helt eller delvis baserad på material från engelskspråkiga Wikipedia, Bacillus amyloliquefaciens, 5 mars 2023.

Noter

[redigera | redigera wikitext]
  1. ^ Molohon, KJ; Melby, JO; Lee, J; Evans, BS; Dunbar, KL; Bumpus, SB; Kelleher, NL; Mitchell, DA (2011). ”Structure Determination and Interception of Biosynthetic Intermediates for the Plantazolicin Class of Highly Discriminating Antibiotics”. ACS Chem. Biol. 6 (12): sid. 1307–1313. doi:10.1021/cb200339d. PMID 21950656. 
  2. ^ [a b c] Tan, Shiyong; Gu, Yian; Yang, Chunlan; Dong, Yue; Mei, Xinlan; Shen, Qirong; Xu, Yangchun (2015-11-21). ”Bacillus amyloliquefaciens T-5 may prevent Ralstonia solanacearum infection through competitive exclusion” (på engelska). Biology and Fertility of Soils 52 (3): sid. 341–351. doi:10.1007/s00374-015-1079-z. ISSN 0178-2762. 
  3. ^ [a b] Huang, Jianfeng; Wei, Zhong; Tan, Shiyong; Mei, Xinlan; Shen, Qirong; Xu, Yangchun (2014-11-05). ”Suppression of Bacterial Wilt of Tomato by Bioorganic Fertilizer Made from the Antibacterial Compound Producing Strain Bacillus amyloliquefaciens HR62”. Journal of Agricultural and Food Chemistry 62 (44): sid. 10708–10716. doi:10.1021/jf503136a. ISSN 0021-8561. PMID 25322261. 
  4. ^ [a b] Zouari, Imen; Jlaiel, Lobna; Tounsi, Slim; Trigui, Mohamed (2016-09-01). ”Biocontrol activity of the endophytic Bacillus amyloliquefaciens strain CEIZ-11 against Pythium aphanidermatum and purification of its bioactive compounds”. Biological Control 100: sid. 54–62. doi:10.1016/j.biocontrol.2016.05.012. 
  5. ^ [a b] Grube, Martin; Schloter, Michael; Smalla, Kornelia; Berg, Gabriele (2015-01-22) (på engelska). The plant microbiome and its importance for plant and human health. Frontiers E-books. Sid. 117–124. ISBN 9782889193783. https://books.google.com/books?id=NtlpBgAAQBAJ&q=Pythium%2520Bacillus%2520amyloliquefaciens&pg=PA117. Läst 5 mars 2023. 
  6. ^ [a b] Soares, Marcos Antônio; Li, Hai-Yan; Bergen, Marshall; Silva, Joaquim Manoel da; Kowalski, Kurt P.; White, James Francis (2015-08-22). ”Functional role of an endophytic Bacillus amyloliquefaciens in enhancing growth and disease protection of invasive English ivy (Hedera helix L.)” (på engelska). Plant and Soil 405 (1–2): sid. 107–123. doi:10.1007/s11104-015-2638-7. ISSN 0032-079X. 
  7. ^ [a b] Shen, Zongzhuan; Wang, Beibei; Lv, Nana; Sun, Yifei; Jiang, Xinyi; Li, Rong; Ruan, Yunze; Shen, Qirong (2015-06-03). ”Effect of the combination of bio-organic fertiliser with Bacillus amyloliquefaciens NJN-6 on the control of banana Fusarium wilt disease, crop production and banana rhizosphere culturable microflora”. Biocontrol Science and Technology 25 (6): sid. 716–731. doi:10.1080/09583157.2015.1010482. ISSN 0958-3157. 
  8. ^ [a b] Liu, Yunpeng; Zhang, Nan; Qiu, Meihua; Feng, Haichao; Vivanco, Jorge M.; Shen, Qirong; Zhang, Ruifu (2014-04-01). ”Enhanced rhizosphere colonization of beneficial Bacillus amyloliquefaciens SQR9 by pathogen infection” (på engelska). FEMS Microbiology Letters 353 (1): sid. 49–56. doi:10.1111/1574-6968.12406. ISSN 1574-6968. PMID 24612247. 
  9. ^ [a b] Chen, Lin; Liu, Yunpeng; Wu, Gengwei; Veronican Njeri, Kimani; Shen, Qirong; Zhang, Nan; Zhang, Ruifu (2016-09-01). ”Induced maize salt tolerance by rhizosphere inoculation of Bacillus amyloliquefaciens SQR9” (på engelska). Physiologia Plantarum 158 (1): sid. 34–44. doi:10.1111/ppl.12441. ISSN 1399-3054. PMID 26932244. 
  10. ^ Qiu, Meihua; Xu, Zhihui; Li, Xingxing; Li, Qing; Zhang, Nan; Shen, Qirong; Zhang, Ruifu (2014-12-05). ”Comparative Proteomics Analysis of Bacillus amyloliquefaciens SQR9 Revealed the Key Proteins Involved in in Situ Root Colonization”. Journal of Proteome Research 13 (12): sid. 5581–5591. doi:10.1021/pr500565m. ISSN 1535-3893. PMID 25299960. 
  11. ^ J. Fukumoto (1943). ”Studies on the production of bacterial amylase. I. Isolation of bacteria secreting potent amylases and their distribution” (på japanska). Journal of the Agricultural Chemical Society of Japan 19 (7): sid. 487–503. doi:10.1271/nogeikagaku1924.19.7_487. 
  12. ^ Wu, Liming; Wu, Huijun; Chen, Lina; Lin, Ling; Borriss, Rainer; Gao, Xuewen (2014-12-04). ”Bacilysin overproduction in Bacillus amyloliquefaciens FZB42 markerless derivative strains FZBREP and FZBSPA enhances antibacterial activity” (på engelska). Applied Microbiology and Biotechnology 99 (10): sid. 4255–4263. doi:10.1007/s00253-014-6251-0. ISSN 0175-7598. PMID 25472439. 
  13. ^ Tan, Shiyong; Jiang, Yi; Song, Song; Huang, Jianfeng; Ling, Ning; Xu, Yangchun; Shen, Qirong (2013-01-01). ”Two Bacillus amyloliquefaciens strains isolated using the competitive tomato root enrichment method and their effects on suppressing Ralstonia solanacearum and promoting tomato plant growth”. Crop Protection 43: sid. 134–140. doi:10.1016/j.cropro.2012.08.003. 
  14. ^ *F. G. Priest; M. Goodfellow; L. A. Shute; R. C. W. Berkeley (1987). ”Bacillus amyloliquefaciens sp. nov., nom. rev.”. International Journal of Systematic Bacteriology 37 (1): sid. 69–71. doi:10.1099/00207713-37-1-69. 
  15. ^ ”ATCC 23350”. American Type Culture Collection. https://www.atcc.org/products/23350. Läst 2 oktober 2023. 
  16. ^ ”Bacillus velezensis is not a later heterotypic synonym of Bacillus amyloliquefaciens; Bacillus methylotrophicus, Bacillus amyloliquefaciens subsp plantarum and 'Bacillus oryzicola' are later heterotypic synonyms of Bacillus velezensis based on phylogenomics”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 66 (3): sid. 1212–1217. 2015. doi:10.1099/ijsem.0.000858. PMID 26702995. 

Externa länkar

[redigera | redigera wikitext]