Kilian, även Killian och Cillian, är ett ursprungligen irländskt mansnamn. Namnet var förr populärt i Sverige men har sedan 1900-talets början minskat ganska avsevärt i popularitet. 31 december 2011 fanns det 127 manliga bärare av namnet Kilian, Killian eller Cillian i Sverige, varav 60 med det som tilltalsnamn.[1] Av barnen födda år 2002 var det två stycken pojkar som fick namnet och av dessa fick två det som tilltalsnamn.
Sankt Kilian var en iro-skotsk missionär som antas ha varit den förste som predikat kristendom i Franken. Han led martyrdöden i Würzburg år 689. Namnets ursprung är oklart. Det kan vara en härledning av det gaeliska ordet för kyrka alternativt krig.