Markus Pöyhönen, född 25 oktober 1978 i Vanda, är en finländsk kortdistanslöpare. Han tränas av Asser Pettinen.
Vid EM i München 2002 blev han den förste manlige finländaren någonsin att nå finalen på 100 meter i ett internationellt mästerskap. Han slutade på fjärde plats. Vid inomhus-VM i Birmingham 2003 kom han sjua på 60 meter.
Pöyhönens personliga rekord på 100 meter, 10,23 sekunder, är två hundradelar från det finska rekordet och hans personliga rekord på såväl 50 meter, 5,77 sekunder, som 60 meter, 6,58 sekunder, är gällande finska rekord (2008).
100 meter
| År | Tid | Vind | Plats | Datum |
|---|---|---|---|---|
| 1999 | 10,88 | +1,3 | Brahestad | 14 augusti |
| 2000 | 10,56 | +1,8 | Kouvola | 5 augusti |
| 2001 | 10,36 | -0,3 | Lahtis | 26 augusti |
| 2002 | 10,23 | +1,7 | Joensuu | 20 juli |
| 2003 | 10,26 | +1,2 | Åbo | 23 juli |
| 2005 | 10,38 | +0,3 | Krugersdorp, Sydafrika | 15 januari |
| 2006 | 10,76 | +1,8 | Tammerfors | 7 juni |