Birincil metabolit normal büyümede, gelişmede ve üremede doğrudan bulunan bir metabolit çeşididir. Genelde, canlıda, psikolojik işlevleri yerine getirmekle sorumludurlar. Genellikle çoğu hücre ve canlıda bulunur. Bazı yaygın örnekleri etanol, laktik asit ve bazı aminoasitlerdir.
İkincil metabolit, birinci metabolite zıt olarak, bahsi geçen, büyüme gibi, işlemlerde bulunmaz ama genellikle önemli bir ekolojik işlevi vardır. İkincil metabolitin bazı yaygın örnekleri arasında antibiyotikler, naftalinler, peptitler ve büyüme faktörleride bulunur.
Bitki büyüme düzenleyicileri, bitki büyüme ve gelişmesindeki rolleri sebebiyle, her iki metabolit grubunda da sınıflandırılabilir.[1][2][3][4] Bazıları iki metabolit arası ara üründür.[5]