Endonezyalı karşıtlığı, Endonezyalı düşmanlığı Endonezyalılara, Endonezya'ya ve Endonezya kültürüne karşı olan düşmanlık olarak tanımlanır.
Tarihte Avustralya hükûmetlerinin genellikle Endonezya'nın politikalarını desteklemesine rağmen, Doğu Timor sorununun ve Endonezya tarafından işlenen Doğu Timor Soykırımı'nın Avustralya'da büyük ölçekte rapor edilmesi ülkede Endonezyalı karşıtlığının artması ile sonuçlanmıştır.
Endonezya'daki Çinlilere karşı yapılan sistematik ayrımcılık Çin'de Endonezyalı karşıtlığının gelişmesine neden oldu.
1963 yılında Endonezya'nın Malezya'ya savaş ilan etmesi ile başlayan iki ülke arasındaki çatışmadan beri Malezya halkı arasında Endonezyalı karşıtlığı yükselmektedir.[1] 1963'te, Endonezya'nın İngiliz Borneo'sunu işgalinden kısa süre sonra, Malezya'da bir dizi Endonezyalı karşıtı protestolar meydana geldi.[2]
İki ülke arasındaki 2022 FIFA Dünya Kupası elemeleri - AFC İkinci Tur maçı sırasında Endonezyalı seyircilerin takımlarının Malezya'ya kaybetmesine verdikleri şiddetli tepki, özellikle futbol hayranları arasında Malezya halkının Endonezyalı karşıtı görüşlerinin artmasına sebep oldu.[3]